Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkx6-3Q3UHX8 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkx6-3Q3UHX8 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkx6-3Q3UHX8 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Nkx6-3Q3UHX8 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkx6-3Q3UHX8 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkx6-3Q3UHX8 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkx6-3Q3UHX8 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkx6-3Q3UHX8 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkx6-3Q3UHX8 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkx6-3Q3UHX8 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkx6-3Q3UHX8 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Nkx6-3Q3UHX8 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Nkx6-3Q3UHX8 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkx6-3Q3UHX8 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkx6-3Q3UHX8 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkx6-3Q3UHX8 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkx6-3Q3UHX8 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkx6-3Q3UHX8 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Nkx6-3Q3UHX8 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkx6-3Q3UHX8 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkx6-3Q3UHX8 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkx6-3Q3UHX8 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Nkx6-3Q3UHX8 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkx6-3Q3UHX8 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkx6-3Q3UHX8 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkx6-3Q3UHX8 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Nkx6-3Q3UHX8 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkx6-3Q3UHX8 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkx6-3Q3UHX8 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Nkx6-3Q3UHX8 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkx6-3Q3UHX8 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkx6-3Q3UHX8 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkx6-3Q3UHX8 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkx6-3Q3UHX8 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nkx6-3Q3UHX8 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nkx6-3Q3UHX8 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
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Nkx6-3Q3UHX8 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nkx6-3Q3UHX8 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Nkx6-3Q3UHX8 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nkx6-3Q3UHX8 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nkx6-3Q3UHX8 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Nkx6-3Q3UHX8 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Nkx6-3Q3UHX8 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nkx6-3Q3UHX8 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nkx6-3Q3UHX8 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nkx6-3Q3UHX8 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nkx6-3Q3UHX8 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nkx6-3Q3UHX8 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nkx6-3Q3UHX8 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nkx6-3Q3UHX8 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Nkx6-3Q3UHX8 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nkx6-3Q3UHX8 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nkx6-3Q3UHX8 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Nkx6-3Q3UHX8 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nkx6-3Q3UHX8 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nkx6-3Q3UHX8 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nkx6-3Q3UHX8 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Nkx6-3Q3UHX8 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nkx6-3Q3UHX8 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nkx6-3Q3UHX8 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nkx6-3Q3UHX8 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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