Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHJ8

Rnf44, RING finger protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf44Q3UHJ8 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf44Q3UHJ8 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf44Q3UHJ8 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf44Q3UHJ8 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf44Q3UHJ8 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf44Q3UHJ8 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf44Q3UHJ8 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf44Q3UHJ8 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf44Q3UHJ8 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf44Q3UHJ8 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf44Q3UHJ8 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf44Q3UHJ8 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf44Q3UHJ8 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf44Q3UHJ8 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf44Q3UHJ8 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf44Q3UHJ8 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf44Q3UHJ8 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf44Q3UHJ8 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf44Q3UHJ8 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf44Q3UHJ8 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf44Q3UHJ8 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf44Q3UHJ8 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf44Q3UHJ8 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf44Q3UHJ8 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf44Q3UHJ8 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf44Q3UHJ8 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf44Q3UHJ8 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf44Q3UHJ8 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf44Q3UHJ8 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf44Q3UHJ8 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf44Q3UHJ8 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf44Q3UHJ8 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf44Q3UHJ8 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf44Q3UHJ8 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf44Q3UHJ8 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf44Q3UHJ8 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf44Q3UHJ8 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf44Q3UHJ8 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf44Q3UHJ8 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf44Q3UHJ8 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf44Q3UHJ8 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf44Q3UHJ8 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf44Q3UHJ8 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf44Q3UHJ8 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf44Q3UHJ8 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf44Q3UHJ8 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf44Q3UHJ8 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf44Q3UHJ8 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf44Q3UHJ8 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf44Q3UHJ8 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf44Q3UHJ8 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf44Q3UHJ8 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf44Q3UHJ8 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf44Q3UHJ8 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf44Q3UHJ8 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf44Q3UHJ8 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf44Q3UHJ8 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf44Q3UHJ8 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf44Q3UHJ8 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf44Q3UHJ8 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf44Q3UHJ8 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf44Q3UHJ8 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf44Q3UHJ8 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf44Q3UHJ8 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf44Q3UHJ8 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf44Q3UHJ8 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf44Q3UHJ8 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf44Q3UHJ8 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf44Q3UHJ8 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf44Q3UHJ8 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf44Q3UHJ8 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf44Q3UHJ8 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf44Q3UHJ8 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rnf44Q3UHJ8 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rnf44Q3UHJ8 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rnf44Q3UHJ8 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rnf44Q3UHJ8 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rnf44Q3UHJ8 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf44Q3UHJ8 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf44Q3UHJ8 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf44Q3UHJ8 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf44Q3UHJ8 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf44Q3UHJ8 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf44Q3UHJ8 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf44Q3UHJ8 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf44Q3UHJ8 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf44Q3UHJ8 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf44Q3UHJ8 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf44Q3UHJ8 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf44Q3UHJ8 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf44Q3UHJ8 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf44Q3UHJ8 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf44Q3UHJ8 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf44Q3UHJ8 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf44Q3UHJ8 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnf44Q3UHJ8 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnf44Q3UHJ8 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnf44Q3UHJ8 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnf44Q3UHJ8 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnf44Q3UHJ8 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms