Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFM5

Nom1, Nucleolar MIF4G domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nom1Q3UFM5 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nom1Q3UFM5 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nom1Q3UFM5 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nom1Q3UFM5 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nom1Q3UFM5 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nom1Q3UFM5 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nom1Q3UFM5 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nom1Q3UFM5 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nom1Q3UFM5 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nom1Q3UFM5 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nom1Q3UFM5 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nom1Q3UFM5 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nom1Q3UFM5 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nom1Q3UFM5 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nom1Q3UFM5 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nom1Q3UFM5 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nom1Q3UFM5 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nom1Q3UFM5 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nom1Q3UFM5 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nom1Q3UFM5 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nom1Q3UFM5 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nom1Q3UFM5 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nom1Q3UFM5 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nom1Q3UFM5 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Nom1Q3UFM5 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nom1Q3UFM5 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nom1Q3UFM5 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nom1Q3UFM5 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nom1Q3UFM5 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nom1Q3UFM5 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nom1Q3UFM5 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nom1Q3UFM5 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nom1Q3UFM5 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nom1Q3UFM5 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nom1Q3UFM5 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nom1Q3UFM5 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nom1Q3UFM5 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nom1Q3UFM5 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nom1Q3UFM5 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nom1Q3UFM5 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nom1Q3UFM5 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nom1Q3UFM5 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nom1Q3UFM5 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nom1Q3UFM5 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nom1Q3UFM5 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nom1Q3UFM5 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nom1Q3UFM5 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nom1Q3UFM5 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nom1Q3UFM5 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Nom1Q3UFM5 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Nom1Q3UFM5 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nom1Q3UFM5 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nom1Q3UFM5 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nom1Q3UFM5 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nom1Q3UFM5 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nom1Q3UFM5 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Nom1Q3UFM5 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Nom1Q3UFM5 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nom1Q3UFM5 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nom1Q3UFM5 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nom1Q3UFM5 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nom1Q3UFM5 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nom1Q3UFM5 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nom1Q3UFM5 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nom1Q3UFM5 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nom1Q3UFM5 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nom1Q3UFM5 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nom1Q3UFM5 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nom1Q3UFM5 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nom1Q3UFM5 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nom1Q3UFM5 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nom1Q3UFM5 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nom1Q3UFM5 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nom1Q3UFM5 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nom1Q3UFM5 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Nom1Q3UFM5 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nom1Q3UFM5 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nom1Q3UFM5 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nom1Q3UFM5 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nom1Q3UFM5 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nom1Q3UFM5 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nom1Q3UFM5 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nom1Q3UFM5 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nom1Q3UFM5 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nom1Q3UFM5 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nom1Q3UFM5 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nom1Q3UFM5 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nom1Q3UFM5 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nom1Q3UFM5 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nom1Q3UFM5 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nom1Q3UFM5 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nom1Q3UFM5 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nom1Q3UFM5 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nom1Q3UFM5 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nom1Q3UFM5 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nom1Q3UFM5 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nom1Q3UFM5 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nom1Q3UFM5 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nom1Q3UFM5 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nom1Q3UFM5 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms