Protein–RNA interactions for Protein: Q3UAW9

Brf2, Transcription factor IIIB 50 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brf2Q3UAW9 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brf2Q3UAW9 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brf2Q3UAW9 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brf2Q3UAW9 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brf2Q3UAW9 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brf2Q3UAW9 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brf2Q3UAW9 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brf2Q3UAW9 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brf2Q3UAW9 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brf2Q3UAW9 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brf2Q3UAW9 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brf2Q3UAW9 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brf2Q3UAW9 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brf2Q3UAW9 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brf2Q3UAW9 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brf2Q3UAW9 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brf2Q3UAW9 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brf2Q3UAW9 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brf2Q3UAW9 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brf2Q3UAW9 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brf2Q3UAW9 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brf2Q3UAW9 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Brf2Q3UAW9 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brf2Q3UAW9 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brf2Q3UAW9 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Brf2Q3UAW9 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brf2Q3UAW9 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brf2Q3UAW9 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brf2Q3UAW9 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brf2Q3UAW9 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brf2Q3UAW9 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brf2Q3UAW9 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brf2Q3UAW9 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brf2Q3UAW9 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brf2Q3UAW9 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brf2Q3UAW9 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brf2Q3UAW9 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brf2Q3UAW9 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brf2Q3UAW9 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brf2Q3UAW9 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brf2Q3UAW9 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brf2Q3UAW9 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brf2Q3UAW9 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brf2Q3UAW9 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brf2Q3UAW9 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brf2Q3UAW9 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brf2Q3UAW9 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brf2Q3UAW9 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brf2Q3UAW9 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brf2Q3UAW9 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brf2Q3UAW9 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brf2Q3UAW9 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Brf2Q3UAW9 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Brf2Q3UAW9 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brf2Q3UAW9 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Brf2Q3UAW9 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brf2Q3UAW9 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brf2Q3UAW9 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brf2Q3UAW9 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brf2Q3UAW9 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brf2Q3UAW9 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brf2Q3UAW9 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Brf2Q3UAW9 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Brf2Q3UAW9 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Brf2Q3UAW9 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Brf2Q3UAW9 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Brf2Q3UAW9 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Brf2Q3UAW9 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Brf2Q3UAW9 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Brf2Q3UAW9 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Brf2Q3UAW9 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Brf2Q3UAW9 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Brf2Q3UAW9 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brf2Q3UAW9 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brf2Q3UAW9 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brf2Q3UAW9 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brf2Q3UAW9 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brf2Q3UAW9 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brf2Q3UAW9 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brf2Q3UAW9 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brf2Q3UAW9 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Brf2Q3UAW9 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brf2Q3UAW9 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brf2Q3UAW9 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brf2Q3UAW9 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Brf2Q3UAW9 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brf2Q3UAW9 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brf2Q3UAW9 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brf2Q3UAW9 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Brf2Q3UAW9 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brf2Q3UAW9 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brf2Q3UAW9 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brf2Q3UAW9 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brf2Q3UAW9 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brf2Q3UAW9 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brf2Q3UAW9 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brf2Q3UAW9 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brf2Q3UAW9 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brf2Q3UAW9 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brf2Q3UAW9 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.3 ms