Protein–RNA interactions for Protein: Q3U898

Cops9, COP9 signalosome complex subunit 9, mousemouse

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops9Q3U898 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cops9Q3U898 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cops9Q3U898 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cops9Q3U898 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cops9Q3U898 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cops9Q3U898 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cops9Q3U898 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cops9Q3U898 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cops9Q3U898 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cops9Q3U898 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cops9Q3U898 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cops9Q3U898 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cops9Q3U898 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Cops9Q3U898 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cops9Q3U898 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cops9Q3U898 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cops9Q3U898 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cops9Q3U898 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cops9Q3U898 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cops9Q3U898 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Cops9Q3U898 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cops9Q3U898 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cops9Q3U898 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cops9Q3U898 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cops9Q3U898 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cops9Q3U898 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cops9Q3U898 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cops9Q3U898 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cops9Q3U898 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cops9Q3U898 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cops9Q3U898 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cops9Q3U898 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cops9Q3U898 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cops9Q3U898 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cops9Q3U898 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cops9Q3U898 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cops9Q3U898 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cops9Q3U898 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cops9Q3U898 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cops9Q3U898 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cops9Q3U898 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cops9Q3U898 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cops9Q3U898 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cops9Q3U898 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cops9Q3U898 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cops9Q3U898 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cops9Q3U898 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cops9Q3U898 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cops9Q3U898 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cops9Q3U898 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Cops9Q3U898 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cops9Q3U898 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Cops9Q3U898 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cops9Q3U898 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cops9Q3U898 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cops9Q3U898 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cops9Q3U898 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cops9Q3U898 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cops9Q3U898 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cops9Q3U898 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cops9Q3U898 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cops9Q3U898 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cops9Q3U898 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cops9Q3U898 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cops9Q3U898 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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