Protein–RNA interactions for Protein: Q3U827

Rnf180, E3 ubiquitin-protein ligase RNF180, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf180Q3U827 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
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Rnf180Q3U827 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rnf180Q3U827 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rnf180Q3U827 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
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Rnf180Q3U827 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rnf180Q3U827 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rnf180Q3U827 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
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Rnf180Q3U827 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
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Rnf180Q3U827 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
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Rnf180Q3U827 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
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Rnf180Q3U827 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rnf180Q3U827 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
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Rnf180Q3U827 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
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