Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3U6N9 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3U6N9 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3U6N9 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3U6N9 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3U6N9 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3U6N9 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3U6N9 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3U6N9 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q3U6N9 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q3U6N9 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q3U6N9 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q3U6N9 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q3U6N9 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q3U6N9 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q3U6N9 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q3U6N9 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q3U6N9 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q3U6N9 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q3U6N9 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q3U6N9 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q3U6N9 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q3U6N9 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q3U6N9 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q3U6N9 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q3U6N9 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q3U6N9 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q3U6N9 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q3U6N9 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Q3U6N9 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q3U6N9 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q3U6N9 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q3U6N9 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q3U6N9 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q3U6N9 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q3U6N9 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q3U6N9 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q3U6N9 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q3U6N9 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q3U6N9 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q3U6N9 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q3U6N9 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q3U6N9 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Q3U6N9 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Q3U6N9 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Q3U6N9 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Q3U6N9 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q3U6N9 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q3U6N9 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q3U6N9 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q3U6N9 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q3U6N9 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q3U6N9 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q3U6N9 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q3U6N9 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q3U6N9 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q3U6N9 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q3U6N9 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q3U6N9 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q3U6N9 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Q3U6N9 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q3U6N9 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q3U6N9 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q3U6N9 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Q3U6N9 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q3U6N9 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q3U6N9 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q3U6N9 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q3U6N9 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q3U6N9 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q3U6N9 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q3U6N9 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q3U6N9 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q3U6N9 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q3U6N9 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q3U6N9 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q3U6N9 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q3U6N9 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q3U6N9 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q3U6N9 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q3U6N9 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q3U6N9 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q3U6N9 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q3U6N9 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q3U6N9 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Q3U6N9 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q3U6N9 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q3U6N9 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q3U6N9 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q3U6N9 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q3U6N9 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q3U6N9 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q3U6N9 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q3U6N9 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Q3U6N9 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Q3U6N9 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q3U6N9 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q3U6N9 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q3U6N9 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q3U6N9 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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