Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

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Length 472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ulk3Q3U3Q1 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ulk3Q3U3Q1 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ulk3Q3U3Q1 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ulk3Q3U3Q1 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ulk3Q3U3Q1 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ulk3Q3U3Q1 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ulk3Q3U3Q1 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ulk3Q3U3Q1 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ulk3Q3U3Q1 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ulk3Q3U3Q1 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ulk3Q3U3Q1 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ulk3Q3U3Q1 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ulk3Q3U3Q1 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ulk3Q3U3Q1 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ulk3Q3U3Q1 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ulk3Q3U3Q1 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ulk3Q3U3Q1 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ulk3Q3U3Q1 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ulk3Q3U3Q1 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ulk3Q3U3Q1 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ulk3Q3U3Q1 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ulk3Q3U3Q1 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ulk3Q3U3Q1 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ulk3Q3U3Q1 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ulk3Q3U3Q1 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ulk3Q3U3Q1 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ulk3Q3U3Q1 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ulk3Q3U3Q1 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ulk3Q3U3Q1 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ulk3Q3U3Q1 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ulk3Q3U3Q1 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ulk3Q3U3Q1 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ulk3Q3U3Q1 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ulk3Q3U3Q1 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ulk3Q3U3Q1 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ulk3Q3U3Q1 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ulk3Q3U3Q1 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ulk3Q3U3Q1 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ulk3Q3U3Q1 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ulk3Q3U3Q1 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ulk3Q3U3Q1 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ulk3Q3U3Q1 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ulk3Q3U3Q1 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ulk3Q3U3Q1 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ulk3Q3U3Q1 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ulk3Q3U3Q1 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ulk3Q3U3Q1 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ulk3Q3U3Q1 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ulk3Q3U3Q1 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ulk3Q3U3Q1 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ulk3Q3U3Q1 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ulk3Q3U3Q1 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ulk3Q3U3Q1 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ulk3Q3U3Q1 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ulk3Q3U3Q1 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ulk3Q3U3Q1 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ulk3Q3U3Q1 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ulk3Q3U3Q1 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ulk3Q3U3Q1 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ulk3Q3U3Q1 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ulk3Q3U3Q1 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ulk3Q3U3Q1 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ulk3Q3U3Q1 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ulk3Q3U3Q1 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ulk3Q3U3Q1 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ulk3Q3U3Q1 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ulk3Q3U3Q1 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ulk3Q3U3Q1 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ulk3Q3U3Q1 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ulk3Q3U3Q1 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ulk3Q3U3Q1 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ulk3Q3U3Q1 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ulk3Q3U3Q1 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ulk3Q3U3Q1 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ulk3Q3U3Q1 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ulk3Q3U3Q1 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ulk3Q3U3Q1 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ulk3Q3U3Q1 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ulk3Q3U3Q1 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ulk3Q3U3Q1 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ulk3Q3U3Q1 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ulk3Q3U3Q1 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ulk3Q3U3Q1 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ulk3Q3U3Q1 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ulk3Q3U3Q1 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ulk3Q3U3Q1 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ulk3Q3U3Q1 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ulk3Q3U3Q1 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ulk3Q3U3Q1 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ulk3Q3U3Q1 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ulk3Q3U3Q1 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ulk3Q3U3Q1 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ulk3Q3U3Q1 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ulk3Q3U3Q1 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ulk3Q3U3Q1 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ulk3Q3U3Q1 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ulk3Q3U3Q1 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ulk3Q3U3Q1 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ulk3Q3U3Q1 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms