Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3C9

Gse1, Genetic suppressor element 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gse1Q3U3C9 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gse1Q3U3C9 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gse1Q3U3C9 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gse1Q3U3C9 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gse1Q3U3C9 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gse1Q3U3C9 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gse1Q3U3C9 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gse1Q3U3C9 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gse1Q3U3C9 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gse1Q3U3C9 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gse1Q3U3C9 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gse1Q3U3C9 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gse1Q3U3C9 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gse1Q3U3C9 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gse1Q3U3C9 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gse1Q3U3C9 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gse1Q3U3C9 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gse1Q3U3C9 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Gse1Q3U3C9 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gse1Q3U3C9 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gse1Q3U3C9 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gse1Q3U3C9 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gse1Q3U3C9 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gse1Q3U3C9 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gse1Q3U3C9 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gse1Q3U3C9 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gse1Q3U3C9 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gse1Q3U3C9 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gse1Q3U3C9 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gse1Q3U3C9 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gse1Q3U3C9 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gse1Q3U3C9 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gse1Q3U3C9 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gse1Q3U3C9 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gse1Q3U3C9 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gse1Q3U3C9 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gse1Q3U3C9 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gse1Q3U3C9 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gse1Q3U3C9 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gse1Q3U3C9 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gse1Q3U3C9 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gse1Q3U3C9 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gse1Q3U3C9 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gse1Q3U3C9 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gse1Q3U3C9 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gse1Q3U3C9 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Gse1Q3U3C9 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gse1Q3U3C9 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gse1Q3U3C9 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gse1Q3U3C9 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gse1Q3U3C9 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Gse1Q3U3C9 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gse1Q3U3C9 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gse1Q3U3C9 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gse1Q3U3C9 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gse1Q3U3C9 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gse1Q3U3C9 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gse1Q3U3C9 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gse1Q3U3C9 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gse1Q3U3C9 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gse1Q3U3C9 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gse1Q3U3C9 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gse1Q3U3C9 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gse1Q3U3C9 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gse1Q3U3C9 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gse1Q3U3C9 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gse1Q3U3C9 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gse1Q3U3C9 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gse1Q3U3C9 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gse1Q3U3C9 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gse1Q3U3C9 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gse1Q3U3C9 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gse1Q3U3C9 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gse1Q3U3C9 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gse1Q3U3C9 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gse1Q3U3C9 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gse1Q3U3C9 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Gse1Q3U3C9 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Gse1Q3U3C9 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gse1Q3U3C9 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gse1Q3U3C9 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gse1Q3U3C9 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gse1Q3U3C9 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gse1Q3U3C9 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gse1Q3U3C9 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gse1Q3U3C9 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gse1Q3U3C9 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gse1Q3U3C9 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gse1Q3U3C9 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gse1Q3U3C9 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gse1Q3U3C9 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Gse1Q3U3C9 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gse1Q3U3C9 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gse1Q3U3C9 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gse1Q3U3C9 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gse1Q3U3C9 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gse1Q3U3C9 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gse1Q3U3C9 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gse1Q3U3C9 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gse1Q3U3C9 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms