Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srsf6Q3TWW8 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srsf6Q3TWW8 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srsf6Q3TWW8 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srsf6Q3TWW8 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srsf6Q3TWW8 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srsf6Q3TWW8 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srsf6Q3TWW8 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srsf6Q3TWW8 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srsf6Q3TWW8 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srsf6Q3TWW8 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Srsf6Q3TWW8 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Srsf6Q3TWW8 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Srsf6Q3TWW8 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Srsf6Q3TWW8 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srsf6Q3TWW8 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srsf6Q3TWW8 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srsf6Q3TWW8 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srsf6Q3TWW8 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srsf6Q3TWW8 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Srsf6Q3TWW8 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srsf6Q3TWW8 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srsf6Q3TWW8 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srsf6Q3TWW8 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srsf6Q3TWW8 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srsf6Q3TWW8 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srsf6Q3TWW8 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srsf6Q3TWW8 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Srsf6Q3TWW8 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srsf6Q3TWW8 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srsf6Q3TWW8 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srsf6Q3TWW8 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srsf6Q3TWW8 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Srsf6Q3TWW8 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srsf6Q3TWW8 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Srsf6Q3TWW8 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Srsf6Q3TWW8 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srsf6Q3TWW8 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srsf6Q3TWW8 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srsf6Q3TWW8 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srsf6Q3TWW8 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srsf6Q3TWW8 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srsf6Q3TWW8 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srsf6Q3TWW8 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srsf6Q3TWW8 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srsf6Q3TWW8 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srsf6Q3TWW8 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srsf6Q3TWW8 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Srsf6Q3TWW8 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Srsf6Q3TWW8 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Srsf6Q3TWW8 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Srsf6Q3TWW8 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Srsf6Q3TWW8 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Srsf6Q3TWW8 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Srsf6Q3TWW8 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Srsf6Q3TWW8 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Srsf6Q3TWW8 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Srsf6Q3TWW8 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Srsf6Q3TWW8 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Srsf6Q3TWW8 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Srsf6Q3TWW8 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Srsf6Q3TWW8 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Srsf6Q3TWW8 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Srsf6Q3TWW8 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Srsf6Q3TWW8 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Srsf6Q3TWW8 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Srsf6Q3TWW8 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Srsf6Q3TWW8 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Srsf6Q3TWW8 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Srsf6Q3TWW8 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Srsf6Q3TWW8 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Srsf6Q3TWW8 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Srsf6Q3TWW8 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Srsf6Q3TWW8 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Srsf6Q3TWW8 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Srsf6Q3TWW8 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Srsf6Q3TWW8 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Srsf6Q3TWW8 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Srsf6Q3TWW8 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Srsf6Q3TWW8 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Srsf6Q3TWW8 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Srsf6Q3TWW8 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Srsf6Q3TWW8 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Srsf6Q3TWW8 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Srsf6Q3TWW8 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Srsf6Q3TWW8 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Srsf6Q3TWW8 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Srsf6Q3TWW8 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Srsf6Q3TWW8 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Srsf6Q3TWW8 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srsf6Q3TWW8 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srsf6Q3TWW8 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srsf6Q3TWW8 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srsf6Q3TWW8 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srsf6Q3TWW8 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srsf6Q3TWW8 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srsf6Q3TWW8 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srsf6Q3TWW8 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srsf6Q3TWW8 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Srsf6Q3TWW8 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms