Protein–RNA interactions for Protein: Q3TSA9

Fbxw18, Expressed sequence C85627, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxw18Q3TSA9 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fbxw18Q3TSA9 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fbxw18Q3TSA9 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fbxw18Q3TSA9 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fbxw18Q3TSA9 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fbxw18Q3TSA9 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fbxw18Q3TSA9 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fbxw18Q3TSA9 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fbxw18Q3TSA9 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fbxw18Q3TSA9 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fbxw18Q3TSA9 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fbxw18Q3TSA9 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Fbxw18Q3TSA9 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fbxw18Q3TSA9 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fbxw18Q3TSA9 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Fbxw18Q3TSA9 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fbxw18Q3TSA9 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fbxw18Q3TSA9 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fbxw18Q3TSA9 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Fbxw18Q3TSA9 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fbxw18Q3TSA9 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fbxw18Q3TSA9 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fbxw18Q3TSA9 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fbxw18Q3TSA9 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fbxw18Q3TSA9 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fbxw18Q3TSA9 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fbxw18Q3TSA9 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fbxw18Q3TSA9 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fbxw18Q3TSA9 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fbxw18Q3TSA9 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fbxw18Q3TSA9 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fbxw18Q3TSA9 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fbxw18Q3TSA9 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fbxw18Q3TSA9 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Fbxw18Q3TSA9 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fbxw18Q3TSA9 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fbxw18Q3TSA9 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fbxw18Q3TSA9 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Fbxw18Q3TSA9 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fbxw18Q3TSA9 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fbxw18Q3TSA9 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fbxw18Q3TSA9 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fbxw18Q3TSA9 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fbxw18Q3TSA9 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fbxw18Q3TSA9 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fbxw18Q3TSA9 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fbxw18Q3TSA9 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fbxw18Q3TSA9 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fbxw18Q3TSA9 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fbxw18Q3TSA9 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fbxw18Q3TSA9 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fbxw18Q3TSA9 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fbxw18Q3TSA9 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fbxw18Q3TSA9 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fbxw18Q3TSA9 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fbxw18Q3TSA9 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fbxw18Q3TSA9 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fbxw18Q3TSA9 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fbxw18Q3TSA9 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fbxw18Q3TSA9 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fbxw18Q3TSA9 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fbxw18Q3TSA9 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fbxw18Q3TSA9 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fbxw18Q3TSA9 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fbxw18Q3TSA9 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fbxw18Q3TSA9 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fbxw18Q3TSA9 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fbxw18Q3TSA9 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fbxw18Q3TSA9 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fbxw18Q3TSA9 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fbxw18Q3TSA9 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fbxw18Q3TSA9 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fbxw18Q3TSA9 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fbxw18Q3TSA9 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fbxw18Q3TSA9 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fbxw18Q3TSA9 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fbxw18Q3TSA9 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fbxw18Q3TSA9 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Fbxw18Q3TSA9 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fbxw18Q3TSA9 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fbxw18Q3TSA9 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fbxw18Q3TSA9 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fbxw18Q3TSA9 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fbxw18Q3TSA9 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fbxw18Q3TSA9 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Fbxw18Q3TSA9 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Fbxw18Q3TSA9 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fbxw18Q3TSA9 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fbxw18Q3TSA9 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fbxw18Q3TSA9 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fbxw18Q3TSA9 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fbxw18Q3TSA9 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fbxw18Q3TSA9 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Fbxw18Q3TSA9 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fbxw18Q3TSA9 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fbxw18Q3TSA9 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fbxw18Q3TSA9 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fbxw18Q3TSA9 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fbxw18Q3TSA9 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fbxw18Q3TSA9 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms