Protein–RNA interactions for Protein: Q3TR08

Fndc4, Fibronectin type III domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc4Q3TR08 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Fndc4Q3TR08 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Fndc4Q3TR08 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Fndc4Q3TR08 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Fndc4Q3TR08 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Fndc4Q3TR08 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Fndc4Q3TR08 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Fndc4Q3TR08 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Fndc4Q3TR08 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Fndc4Q3TR08 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Fndc4Q3TR08 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Fndc4Q3TR08 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Fndc4Q3TR08 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Fndc4Q3TR08 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Fndc4Q3TR08 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Fndc4Q3TR08 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Fndc4Q3TR08 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Fndc4Q3TR08 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Fndc4Q3TR08 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Fndc4Q3TR08 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Fndc4Q3TR08 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Fndc4Q3TR08 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Fndc4Q3TR08 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Fndc4Q3TR08 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Fndc4Q3TR08 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Fndc4Q3TR08 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Fndc4Q3TR08 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Fndc4Q3TR08 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Fndc4Q3TR08 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Fndc4Q3TR08 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Fndc4Q3TR08 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Fndc4Q3TR08 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Fndc4Q3TR08 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Fndc4Q3TR08 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Fndc4Q3TR08 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Fndc4Q3TR08 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Fndc4Q3TR08 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Fndc4Q3TR08 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Fndc4Q3TR08 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Fndc4Q3TR08 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Fndc4Q3TR08 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Fndc4Q3TR08 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Fndc4Q3TR08 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Fndc4Q3TR08 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Fndc4Q3TR08 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Fndc4Q3TR08 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Fndc4Q3TR08 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Fndc4Q3TR08 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Fndc4Q3TR08 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Fndc4Q3TR08 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Fndc4Q3TR08 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Fndc4Q3TR08 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Fndc4Q3TR08 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Fndc4Q3TR08 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Fndc4Q3TR08 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Fndc4Q3TR08 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Fndc4Q3TR08 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Fndc4Q3TR08 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Fndc4Q3TR08 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Fndc4Q3TR08 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Fndc4Q3TR08 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Fndc4Q3TR08 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Fndc4Q3TR08 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Fndc4Q3TR08 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Fndc4Q3TR08 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Fndc4Q3TR08 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Fndc4Q3TR08 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Fndc4Q3TR08 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Fndc4Q3TR08 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Fndc4Q3TR08 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Fndc4Q3TR08 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Fndc4Q3TR08 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Fndc4Q3TR08 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Fndc4Q3TR08 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Fndc4Q3TR08 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Fndc4Q3TR08 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Fndc4Q3TR08 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Fndc4Q3TR08 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Fndc4Q3TR08 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Fndc4Q3TR08 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Fndc4Q3TR08 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Fndc4Q3TR08 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Fndc4Q3TR08 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Fndc4Q3TR08 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Fndc4Q3TR08 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Fndc4Q3TR08 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Fndc4Q3TR08 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Fndc4Q3TR08 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Fndc4Q3TR08 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Fndc4Q3TR08 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Fndc4Q3TR08 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Fndc4Q3TR08 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Fndc4Q3TR08 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Fndc4Q3TR08 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Fndc4Q3TR08 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Fndc4Q3TR08 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Fndc4Q3TR08 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Fndc4Q3TR08 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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