Protein–RNA interactions for Protein: Q3TC33

Ccdc127, Coiled-coil domain-containing protein 127, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc127Q3TC33 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc127Q3TC33 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc127Q3TC33 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc127Q3TC33 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc127Q3TC33 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc127Q3TC33 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc127Q3TC33 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc127Q3TC33 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc127Q3TC33 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc127Q3TC33 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc127Q3TC33 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc127Q3TC33 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc127Q3TC33 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc127Q3TC33 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc127Q3TC33 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc127Q3TC33 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc127Q3TC33 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc127Q3TC33 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc127Q3TC33 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc127Q3TC33 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc127Q3TC33 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc127Q3TC33 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc127Q3TC33 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc127Q3TC33 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc127Q3TC33 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc127Q3TC33 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc127Q3TC33 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc127Q3TC33 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc127Q3TC33 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc127Q3TC33 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc127Q3TC33 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc127Q3TC33 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc127Q3TC33 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc127Q3TC33 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc127Q3TC33 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc127Q3TC33 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc127Q3TC33 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc127Q3TC33 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc127Q3TC33 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc127Q3TC33 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc127Q3TC33 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc127Q3TC33 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc127Q3TC33 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc127Q3TC33 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc127Q3TC33 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc127Q3TC33 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc127Q3TC33 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc127Q3TC33 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc127Q3TC33 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc127Q3TC33 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc127Q3TC33 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc127Q3TC33 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc127Q3TC33 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc127Q3TC33 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc127Q3TC33 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc127Q3TC33 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc127Q3TC33 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc127Q3TC33 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc127Q3TC33 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc127Q3TC33 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc127Q3TC33 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc127Q3TC33 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc127Q3TC33 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc127Q3TC33 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc127Q3TC33 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc127Q3TC33 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc127Q3TC33 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc127Q3TC33 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc127Q3TC33 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc127Q3TC33 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc127Q3TC33 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc127Q3TC33 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc127Q3TC33 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc127Q3TC33 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc127Q3TC33 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc127Q3TC33 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc127Q3TC33 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc127Q3TC33 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc127Q3TC33 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc127Q3TC33 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc127Q3TC33 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc127Q3TC33 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc127Q3TC33 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc127Q3TC33 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc127Q3TC33 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc127Q3TC33 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc127Q3TC33 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc127Q3TC33 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc127Q3TC33 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc127Q3TC33 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc127Q3TC33 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc127Q3TC33 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc127Q3TC33 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc127Q3TC33 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc127Q3TC33 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc127Q3TC33 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc127Q3TC33 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc127Q3TC33 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc127Q3TC33 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc127Q3TC33 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms