Protein–RNA interactions for Protein: Q3TAP4

Ap5b1, AP-5 complex subunit beta-1, mousemouse

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Length 876 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap5b1Q3TAP4 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
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Ap5b1Q3TAP4 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ap5b1Q3TAP4 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ap5b1Q3TAP4 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ap5b1Q3TAP4 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ap5b1Q3TAP4 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ap5b1Q3TAP4 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Ap5b1Q3TAP4 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Ap5b1Q3TAP4 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Ap5b1Q3TAP4 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Ap5b1Q3TAP4 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ap5b1Q3TAP4 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ap5b1Q3TAP4 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ap5b1Q3TAP4 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
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Ap5b1Q3TAP4 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ap5b1Q3TAP4 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ap5b1Q3TAP4 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ap5b1Q3TAP4 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ap5b1Q3TAP4 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ap5b1Q3TAP4 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Ap5b1Q3TAP4 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ap5b1Q3TAP4 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Ap5b1Q3TAP4 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Ap5b1Q3TAP4 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ap5b1Q3TAP4 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ap5b1Q3TAP4 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ap5b1Q3TAP4 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ap5b1Q3TAP4 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ap5b1Q3TAP4 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ap5b1Q3TAP4 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ap5b1Q3TAP4 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ap5b1Q3TAP4 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ap5b1Q3TAP4 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ap5b1Q3TAP4 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ap5b1Q3TAP4 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Ap5b1Q3TAP4 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Ap5b1Q3TAP4 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Ap5b1Q3TAP4 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Ap5b1Q3TAP4 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Ap5b1Q3TAP4 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ap5b1Q3TAP4 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ap5b1Q3TAP4 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ap5b1Q3TAP4 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ap5b1Q3TAP4 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ap5b1Q3TAP4 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ap5b1Q3TAP4 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ap5b1Q3TAP4 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ap5b1Q3TAP4 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ap5b1Q3TAP4 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ap5b1Q3TAP4 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ap5b1Q3TAP4 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ap5b1Q3TAP4 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ap5b1Q3TAP4 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ap5b1Q3TAP4 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ap5b1Q3TAP4 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ap5b1Q3TAP4 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ap5b1Q3TAP4 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ap5b1Q3TAP4 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ap5b1Q3TAP4 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ap5b1Q3TAP4 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ap5b1Q3TAP4 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ap5b1Q3TAP4 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ap5b1Q3TAP4 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ap5b1Q3TAP4 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ap5b1Q3TAP4 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ap5b1Q3TAP4 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ap5b1Q3TAP4 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ap5b1Q3TAP4 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ap5b1Q3TAP4 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ap5b1Q3TAP4 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ap5b1Q3TAP4 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ap5b1Q3TAP4 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms