Protein–RNA interactions for Protein: Q14C51

Ptcd3, Pentatricopeptide repeat domain-containing protein 3, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptcd3Q14C51 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ptcd3Q14C51 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ptcd3Q14C51 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ptcd3Q14C51 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ptcd3Q14C51 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ptcd3Q14C51 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ptcd3Q14C51 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ptcd3Q14C51 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ptcd3Q14C51 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ptcd3Q14C51 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ptcd3Q14C51 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ptcd3Q14C51 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ptcd3Q14C51 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ptcd3Q14C51 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ptcd3Q14C51 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ptcd3Q14C51 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ptcd3Q14C51 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ptcd3Q14C51 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ptcd3Q14C51 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ptcd3Q14C51 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ptcd3Q14C51 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ptcd3Q14C51 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ptcd3Q14C51 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ptcd3Q14C51 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ptcd3Q14C51 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ptcd3Q14C51 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ptcd3Q14C51 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ptcd3Q14C51 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ptcd3Q14C51 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ptcd3Q14C51 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ptcd3Q14C51 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ptcd3Q14C51 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ptcd3Q14C51 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ptcd3Q14C51 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ptcd3Q14C51 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ptcd3Q14C51 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ptcd3Q14C51 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ptcd3Q14C51 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ptcd3Q14C51 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ptcd3Q14C51 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ptcd3Q14C51 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ptcd3Q14C51 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ptcd3Q14C51 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ptcd3Q14C51 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ptcd3Q14C51 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ptcd3Q14C51 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ptcd3Q14C51 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ptcd3Q14C51 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ptcd3Q14C51 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ptcd3Q14C51 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ptcd3Q14C51 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ptcd3Q14C51 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ptcd3Q14C51 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ptcd3Q14C51 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ptcd3Q14C51 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ptcd3Q14C51 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ptcd3Q14C51 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ptcd3Q14C51 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ptcd3Q14C51 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ptcd3Q14C51 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptcd3Q14C51 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptcd3Q14C51 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptcd3Q14C51 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptcd3Q14C51 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptcd3Q14C51 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptcd3Q14C51 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptcd3Q14C51 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptcd3Q14C51 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptcd3Q14C51 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptcd3Q14C51 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptcd3Q14C51 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptcd3Q14C51 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptcd3Q14C51 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptcd3Q14C51 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptcd3Q14C51 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptcd3Q14C51 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptcd3Q14C51 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptcd3Q14C51 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptcd3Q14C51 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptcd3Q14C51 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptcd3Q14C51 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptcd3Q14C51 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptcd3Q14C51 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptcd3Q14C51 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptcd3Q14C51 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptcd3Q14C51 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptcd3Q14C51 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptcd3Q14C51 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptcd3Q14C51 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptcd3Q14C51 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptcd3Q14C51 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptcd3Q14C51 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptcd3Q14C51 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ptcd3Q14C51 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ptcd3Q14C51 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Ptcd3Q14C51 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ptcd3Q14C51 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptcd3Q14C51 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptcd3Q14C51 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptcd3Q14C51 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms