Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rpusd3Q14AI6 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rpusd3Q14AI6 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rpusd3Q14AI6 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rpusd3Q14AI6 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rpusd3Q14AI6 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rpusd3Q14AI6 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rpusd3Q14AI6 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rpusd3Q14AI6 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rpusd3Q14AI6 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rpusd3Q14AI6 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rpusd3Q14AI6 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rpusd3Q14AI6 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rpusd3Q14AI6 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rpusd3Q14AI6 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rpusd3Q14AI6 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Rpusd3Q14AI6 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rpusd3Q14AI6 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rpusd3Q14AI6 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Rpusd3Q14AI6 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rpusd3Q14AI6 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rpusd3Q14AI6 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rpusd3Q14AI6 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rpusd3Q14AI6 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rpusd3Q14AI6 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rpusd3Q14AI6 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rpusd3Q14AI6 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rpusd3Q14AI6 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rpusd3Q14AI6 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rpusd3Q14AI6 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rpusd3Q14AI6 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rpusd3Q14AI6 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rpusd3Q14AI6 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
Rpusd3Q14AI6 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.15
Rpusd3Q14AI6 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
Rpusd3Q14AI6 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rpusd3Q14AI6 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rpusd3Q14AI6 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rpusd3Q14AI6 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rpusd3Q14AI6 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rpusd3Q14AI6 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rpusd3Q14AI6 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rpusd3Q14AI6 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rpusd3Q14AI6 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rpusd3Q14AI6 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rpusd3Q14AI6 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rpusd3Q14AI6 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rpusd3Q14AI6 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rpusd3Q14AI6 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rpusd3Q14AI6 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rpusd3Q14AI6 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rpusd3Q14AI6 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rpusd3Q14AI6 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rpusd3Q14AI6 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Rpusd3Q14AI6 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rpusd3Q14AI6 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rpusd3Q14AI6 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rpusd3Q14AI6 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rpusd3Q14AI6 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
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Rpusd3Q14AI6 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rpusd3Q14AI6 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rpusd3Q14AI6 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rpusd3Q14AI6 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rpusd3Q14AI6 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rpusd3Q14AI6 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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Rpusd3Q14AI6 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rpusd3Q14AI6 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rpusd3Q14AI6 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rpusd3Q14AI6 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rpusd3Q14AI6 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rpusd3Q14AI6 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rpusd3Q14AI6 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rpusd3Q14AI6 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rpusd3Q14AI6 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rpusd3Q14AI6 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rpusd3Q14AI6 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rpusd3Q14AI6 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rpusd3Q14AI6 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rpusd3Q14AI6 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rpusd3Q14AI6 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rpusd3Q14AI6 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rpusd3Q14AI6 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rpusd3Q14AI6 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rpusd3Q14AI6 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rpusd3Q14AI6 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rpusd3Q14AI6 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rpusd3Q14AI6 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rpusd3Q14AI6 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rpusd3Q14AI6 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rpusd3Q14AI6 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rpusd3Q14AI6 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Rpusd3Q14AI6 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Rpusd3Q14AI6 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rpusd3Q14AI6 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rpusd3Q14AI6 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rpusd3Q14AI6 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rpusd3Q14AI6 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rpusd3Q14AI6 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms