Protein–RNA interactions for Protein: Q148B6

Spatc1, Speriolin, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spatc1Q148B6 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Spatc1Q148B6 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Spatc1Q148B6 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Spatc1Q148B6 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Spatc1Q148B6 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Spatc1Q148B6 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Spatc1Q148B6 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Spatc1Q148B6 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Spatc1Q148B6 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Spatc1Q148B6 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Spatc1Q148B6 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Spatc1Q148B6 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Spatc1Q148B6 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Spatc1Q148B6 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Spatc1Q148B6 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Spatc1Q148B6 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Spatc1Q148B6 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Spatc1Q148B6 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Spatc1Q148B6 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Spatc1Q148B6 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Spatc1Q148B6 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Spatc1Q148B6 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Spatc1Q148B6 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Spatc1Q148B6 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Spatc1Q148B6 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Spatc1Q148B6 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Spatc1Q148B6 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Spatc1Q148B6 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Spatc1Q148B6 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Spatc1Q148B6 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Spatc1Q148B6 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Spatc1Q148B6 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Spatc1Q148B6 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Spatc1Q148B6 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Spatc1Q148B6 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Spatc1Q148B6 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Spatc1Q148B6 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Spatc1Q148B6 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Spatc1Q148B6 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Spatc1Q148B6 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Spatc1Q148B6 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Spatc1Q148B6 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Spatc1Q148B6 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Spatc1Q148B6 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Spatc1Q148B6 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Spatc1Q148B6 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Spatc1Q148B6 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Spatc1Q148B6 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Spatc1Q148B6 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Spatc1Q148B6 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Spatc1Q148B6 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Spatc1Q148B6 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Spatc1Q148B6 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Spatc1Q148B6 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Spatc1Q148B6 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Spatc1Q148B6 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Spatc1Q148B6 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Spatc1Q148B6 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Spatc1Q148B6 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Spatc1Q148B6 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Spatc1Q148B6 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Spatc1Q148B6 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Spatc1Q148B6 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Spatc1Q148B6 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Spatc1Q148B6 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Spatc1Q148B6 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Spatc1Q148B6 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Spatc1Q148B6 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Spatc1Q148B6 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Spatc1Q148B6 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Spatc1Q148B6 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Spatc1Q148B6 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Spatc1Q148B6 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Spatc1Q148B6 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Spatc1Q148B6 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Spatc1Q148B6 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Spatc1Q148B6 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Spatc1Q148B6 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Spatc1Q148B6 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Spatc1Q148B6 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Spatc1Q148B6 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Spatc1Q148B6 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Spatc1Q148B6 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Spatc1Q148B6 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Spatc1Q148B6 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Spatc1Q148B6 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Spatc1Q148B6 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Spatc1Q148B6 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Spatc1Q148B6 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Spatc1Q148B6 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Spatc1Q148B6 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Spatc1Q148B6 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Spatc1Q148B6 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Spatc1Q148B6 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Spatc1Q148B6 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Spatc1Q148B6 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Spatc1Q148B6 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Spatc1Q148B6 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Spatc1Q148B6 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Spatc1Q148B6 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms