Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ttc21bQ0HA38 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ttc21bQ0HA38 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ttc21bQ0HA38 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ttc21bQ0HA38 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ttc21bQ0HA38 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ttc21bQ0HA38 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ttc21bQ0HA38 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ttc21bQ0HA38 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ttc21bQ0HA38 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ttc21bQ0HA38 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ttc21bQ0HA38 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ttc21bQ0HA38 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ttc21bQ0HA38 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ttc21bQ0HA38 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ttc21bQ0HA38 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ttc21bQ0HA38 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ttc21bQ0HA38 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ttc21bQ0HA38 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ttc21bQ0HA38 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ttc21bQ0HA38 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ttc21bQ0HA38 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ttc21bQ0HA38 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ttc21bQ0HA38 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ttc21bQ0HA38 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ttc21bQ0HA38 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ttc21bQ0HA38 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ttc21bQ0HA38 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ttc21bQ0HA38 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ttc21bQ0HA38 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ttc21bQ0HA38 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ttc21bQ0HA38 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ttc21bQ0HA38 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ttc21bQ0HA38 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ttc21bQ0HA38 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ttc21bQ0HA38 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ttc21bQ0HA38 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ttc21bQ0HA38 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ttc21bQ0HA38 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ttc21bQ0HA38 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ttc21bQ0HA38 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ttc21bQ0HA38 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ttc21bQ0HA38 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ttc21bQ0HA38 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ttc21bQ0HA38 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ttc21bQ0HA38 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ttc21bQ0HA38 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ttc21bQ0HA38 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ttc21bQ0HA38 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ttc21bQ0HA38 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ttc21bQ0HA38 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ttc21bQ0HA38 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ttc21bQ0HA38 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ttc21bQ0HA38 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ttc21bQ0HA38 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ttc21bQ0HA38 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Ttc21bQ0HA38 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ttc21bQ0HA38 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ttc21bQ0HA38 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ttc21bQ0HA38 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ttc21bQ0HA38 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ttc21bQ0HA38 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ttc21bQ0HA38 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ttc21bQ0HA38 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ttc21bQ0HA38 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ttc21bQ0HA38 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ttc21bQ0HA38 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ttc21bQ0HA38 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ttc21bQ0HA38 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ttc21bQ0HA38 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ttc21bQ0HA38 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ttc21bQ0HA38 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ttc21bQ0HA38 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ttc21bQ0HA38 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ttc21bQ0HA38 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ttc21bQ0HA38 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ttc21bQ0HA38 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ttc21bQ0HA38 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ttc21bQ0HA38 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ttc21bQ0HA38 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ttc21bQ0HA38 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ttc21bQ0HA38 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ttc21bQ0HA38 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ttc21bQ0HA38 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ttc21bQ0HA38 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ttc21bQ0HA38 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ttc21bQ0HA38 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ttc21bQ0HA38 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ttc21bQ0HA38 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ttc21bQ0HA38 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ttc21bQ0HA38 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ttc21bQ0HA38 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ttc21bQ0HA38 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ttc21bQ0HA38 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ttc21bQ0HA38 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ttc21bQ0HA38 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ttc21bQ0HA38 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ttc21bQ0HA38 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ttc21bQ0HA38 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ttc21bQ0HA38 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms