Protein–RNA interactions for Protein: Q09143

Slc7a1, High affinity cationic amino acid transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc7a1Q09143 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc7a1Q09143 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc7a1Q09143 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc7a1Q09143 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc7a1Q09143 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc7a1Q09143 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc7a1Q09143 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc7a1Q09143 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc7a1Q09143 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc7a1Q09143 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc7a1Q09143 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc7a1Q09143 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc7a1Q09143 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc7a1Q09143 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc7a1Q09143 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc7a1Q09143 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc7a1Q09143 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc7a1Q09143 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc7a1Q09143 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc7a1Q09143 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc7a1Q09143 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc7a1Q09143 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc7a1Q09143 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc7a1Q09143 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc7a1Q09143 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc7a1Q09143 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc7a1Q09143 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc7a1Q09143 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc7a1Q09143 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc7a1Q09143 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc7a1Q09143 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc7a1Q09143 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc7a1Q09143 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc7a1Q09143 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc7a1Q09143 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc7a1Q09143 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc7a1Q09143 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc7a1Q09143 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc7a1Q09143 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc7a1Q09143 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc7a1Q09143 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc7a1Q09143 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc7a1Q09143 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc7a1Q09143 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc7a1Q09143 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc7a1Q09143 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc7a1Q09143 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc7a1Q09143 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc7a1Q09143 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc7a1Q09143 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc7a1Q09143 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc7a1Q09143 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc7a1Q09143 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc7a1Q09143 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc7a1Q09143 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc7a1Q09143 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc7a1Q09143 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc7a1Q09143 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc7a1Q09143 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Slc7a1Q09143 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Slc7a1Q09143 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Slc7a1Q09143 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Slc7a1Q09143 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Slc7a1Q09143 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Slc7a1Q09143 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Slc7a1Q09143 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Slc7a1Q09143 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Slc7a1Q09143 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc7a1Q09143 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc7a1Q09143 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc7a1Q09143 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc7a1Q09143 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc7a1Q09143 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc7a1Q09143 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc7a1Q09143 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc7a1Q09143 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc7a1Q09143 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc7a1Q09143 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc7a1Q09143 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc7a1Q09143 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc7a1Q09143 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc7a1Q09143 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc7a1Q09143 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc7a1Q09143 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc7a1Q09143 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc7a1Q09143 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc7a1Q09143 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc7a1Q09143 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc7a1Q09143 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc7a1Q09143 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc7a1Q09143 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc7a1Q09143 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc7a1Q09143 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc7a1Q09143 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc7a1Q09143 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc7a1Q09143 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc7a1Q09143 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc7a1Q09143 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc7a1Q09143 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc7a1Q09143 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms