Protein–RNA interactions for Protein: Q08943

Ssrp1, FACT complex subunit SSRP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssrp1Q08943 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ssrp1Q08943 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ssrp1Q08943 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ssrp1Q08943 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ssrp1Q08943 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ssrp1Q08943 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ssrp1Q08943 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ssrp1Q08943 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ssrp1Q08943 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ssrp1Q08943 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ssrp1Q08943 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ssrp1Q08943 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ssrp1Q08943 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ssrp1Q08943 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ssrp1Q08943 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ssrp1Q08943 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ssrp1Q08943 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ssrp1Q08943 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ssrp1Q08943 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ssrp1Q08943 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ssrp1Q08943 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ssrp1Q08943 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ssrp1Q08943 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ssrp1Q08943 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ssrp1Q08943 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ssrp1Q08943 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ssrp1Q08943 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ssrp1Q08943 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ssrp1Q08943 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ssrp1Q08943 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ssrp1Q08943 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ssrp1Q08943 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ssrp1Q08943 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ssrp1Q08943 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ssrp1Q08943 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ssrp1Q08943 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ssrp1Q08943 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ssrp1Q08943 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ssrp1Q08943 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ssrp1Q08943 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ssrp1Q08943 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ssrp1Q08943 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ssrp1Q08943 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ssrp1Q08943 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ssrp1Q08943 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ssrp1Q08943 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ssrp1Q08943 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ssrp1Q08943 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ssrp1Q08943 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ssrp1Q08943 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ssrp1Q08943 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ssrp1Q08943 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ssrp1Q08943 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ssrp1Q08943 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ssrp1Q08943 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ssrp1Q08943 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ssrp1Q08943 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ssrp1Q08943 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ssrp1Q08943 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ssrp1Q08943 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ssrp1Q08943 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ssrp1Q08943 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ssrp1Q08943 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ssrp1Q08943 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ssrp1Q08943 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ssrp1Q08943 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ssrp1Q08943 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ssrp1Q08943 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ssrp1Q08943 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ssrp1Q08943 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ssrp1Q08943 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ssrp1Q08943 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ssrp1Q08943 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ssrp1Q08943 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ssrp1Q08943 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ssrp1Q08943 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ssrp1Q08943 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ssrp1Q08943 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ssrp1Q08943 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ssrp1Q08943 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ssrp1Q08943 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ssrp1Q08943 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ssrp1Q08943 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ssrp1Q08943 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ssrp1Q08943 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ssrp1Q08943 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ssrp1Q08943 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ssrp1Q08943 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ssrp1Q08943 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ssrp1Q08943 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ssrp1Q08943 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ssrp1Q08943 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ssrp1Q08943 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ssrp1Q08943 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ssrp1Q08943 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ssrp1Q08943 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ssrp1Q08943 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ssrp1Q08943 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ssrp1Q08943 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ssrp1Q08943 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms