Protein–RNA interactions for Protein: Q08642

Padi2, Protein-arginine deiminase type-2, mousemouse

Predictions only

Length 673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Padi2Q08642 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Padi2Q08642 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Padi2Q08642 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Padi2Q08642 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Padi2Q08642 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Padi2Q08642 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Padi2Q08642 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Padi2Q08642 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Padi2Q08642 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Padi2Q08642 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Padi2Q08642 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Padi2Q08642 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Padi2Q08642 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Padi2Q08642 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Padi2Q08642 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Padi2Q08642 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Padi2Q08642 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Padi2Q08642 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Padi2Q08642 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Padi2Q08642 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Padi2Q08642 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Padi2Q08642 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Padi2Q08642 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Padi2Q08642 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Padi2Q08642 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Padi2Q08642 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Padi2Q08642 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Padi2Q08642 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Padi2Q08642 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Padi2Q08642 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Padi2Q08642 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Padi2Q08642 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Padi2Q08642 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Padi2Q08642 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Padi2Q08642 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Padi2Q08642 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Padi2Q08642 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Padi2Q08642 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Padi2Q08642 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Padi2Q08642 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Padi2Q08642 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Padi2Q08642 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Padi2Q08642 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Padi2Q08642 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Padi2Q08642 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Padi2Q08642 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Padi2Q08642 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Padi2Q08642 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Padi2Q08642 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Padi2Q08642 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Padi2Q08642 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Padi2Q08642 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Padi2Q08642 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Padi2Q08642 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Padi2Q08642 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Padi2Q08642 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Padi2Q08642 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Padi2Q08642 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Padi2Q08642 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Padi2Q08642 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Padi2Q08642 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Padi2Q08642 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Padi2Q08642 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Padi2Q08642 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Padi2Q08642 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Padi2Q08642 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Padi2Q08642 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Padi2Q08642 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Padi2Q08642 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Padi2Q08642 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Padi2Q08642 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Padi2Q08642 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Padi2Q08642 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Padi2Q08642 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Padi2Q08642 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Padi2Q08642 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Padi2Q08642 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Padi2Q08642 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Padi2Q08642 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Padi2Q08642 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Padi2Q08642 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Padi2Q08642 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Padi2Q08642 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Padi2Q08642 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Padi2Q08642 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Padi2Q08642 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Padi2Q08642 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Padi2Q08642 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Padi2Q08642 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Padi2Q08642 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Padi2Q08642 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Padi2Q08642 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Padi2Q08642 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Padi2Q08642 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Padi2Q08642 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Padi2Q08642 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Padi2Q08642 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Padi2Q08642 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Padi2Q08642 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Padi2Q08642 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms