Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cab39Q06138 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cab39Q06138 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cab39Q06138 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cab39Q06138 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cab39Q06138 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cab39Q06138 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cab39Q06138 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Cab39Q06138 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cab39Q06138 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cab39Q06138 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cab39Q06138 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cab39Q06138 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cab39Q06138 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Cab39Q06138 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cab39Q06138 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cab39Q06138 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cab39Q06138 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cab39Q06138 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cab39Q06138 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cab39Q06138 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cab39Q06138 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cab39Q06138 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cab39Q06138 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cab39Q06138 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Cab39Q06138 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cab39Q06138 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Cab39Q06138 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cab39Q06138 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cab39Q06138 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cab39Q06138 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cab39Q06138 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cab39Q06138 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cab39Q06138 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cab39Q06138 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Cab39Q06138 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cab39Q06138 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cab39Q06138 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cab39Q06138 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cab39Q06138 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cab39Q06138 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cab39Q06138 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cab39Q06138 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Cab39Q06138 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Cab39Q06138 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cab39Q06138 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cab39Q06138 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cab39Q06138 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cab39Q06138 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cab39Q06138 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cab39Q06138 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Cab39Q06138 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cab39Q06138 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cab39Q06138 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cab39Q06138 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Cab39Q06138 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Cab39Q06138 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cab39Q06138 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cab39Q06138 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cab39Q06138 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cab39Q06138 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cab39Q06138 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cab39Q06138 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cab39Q06138 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cab39Q06138 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cab39Q06138 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cab39Q06138 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cab39Q06138 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cab39Q06138 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cab39Q06138 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Cab39Q06138 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Cab39Q06138 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cab39Q06138 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cab39Q06138 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Cab39Q06138 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Cab39Q06138 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Cab39Q06138 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cab39Q06138 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cab39Q06138 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cab39Q06138 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cab39Q06138 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.1 ms