Protein–RNA interactions for Protein: Q05A62

Dnal1, Dynein light chain 1, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnal1Q05A62 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnal1Q05A62 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnal1Q05A62 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnal1Q05A62 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnal1Q05A62 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnal1Q05A62 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnal1Q05A62 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnal1Q05A62 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnal1Q05A62 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnal1Q05A62 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnal1Q05A62 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnal1Q05A62 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnal1Q05A62 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnal1Q05A62 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnal1Q05A62 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnal1Q05A62 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnal1Q05A62 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnal1Q05A62 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnal1Q05A62 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnal1Q05A62 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnal1Q05A62 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnal1Q05A62 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnal1Q05A62 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnal1Q05A62 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnal1Q05A62 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnal1Q05A62 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnal1Q05A62 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnal1Q05A62 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnal1Q05A62 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnal1Q05A62 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnal1Q05A62 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnal1Q05A62 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnal1Q05A62 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnal1Q05A62 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnal1Q05A62 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnal1Q05A62 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnal1Q05A62 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnal1Q05A62 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnal1Q05A62 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnal1Q05A62 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnal1Q05A62 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnal1Q05A62 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnal1Q05A62 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnal1Q05A62 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnal1Q05A62 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnal1Q05A62 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnal1Q05A62 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnal1Q05A62 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnal1Q05A62 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnal1Q05A62 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dnal1Q05A62 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dnal1Q05A62 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dnal1Q05A62 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dnal1Q05A62 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dnal1Q05A62 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dnal1Q05A62 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dnal1Q05A62 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dnal1Q05A62 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dnal1Q05A62 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dnal1Q05A62 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dnal1Q05A62 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dnal1Q05A62 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Dnal1Q05A62 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Dnal1Q05A62 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Dnal1Q05A62 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Dnal1Q05A62 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Dnal1Q05A62 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Dnal1Q05A62 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Dnal1Q05A62 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Dnal1Q05A62 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Dnal1Q05A62 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Dnal1Q05A62 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Dnal1Q05A62 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Dnal1Q05A62 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Dnal1Q05A62 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Dnal1Q05A62 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Dnal1Q05A62 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dnal1Q05A62 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dnal1Q05A62 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dnal1Q05A62 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dnal1Q05A62 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dnal1Q05A62 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dnal1Q05A62 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dnal1Q05A62 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dnal1Q05A62 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dnal1Q05A62 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dnal1Q05A62 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dnal1Q05A62 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dnal1Q05A62 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dnal1Q05A62 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dnal1Q05A62 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dnal1Q05A62 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dnal1Q05A62 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Dnal1Q05A62 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dnal1Q05A62 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dnal1Q05A62 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dnal1Q05A62 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dnal1Q05A62 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Dnal1Q05A62 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dnal1Q05A62 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms