Protein–RNA interactions for Protein: Q05186

Rcn1, Reticulocalbin-1, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcn1Q05186 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rcn1Q05186 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rcn1Q05186 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rcn1Q05186 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rcn1Q05186 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rcn1Q05186 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rcn1Q05186 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rcn1Q05186 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rcn1Q05186 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rcn1Q05186 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rcn1Q05186 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rcn1Q05186 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rcn1Q05186 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rcn1Q05186 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rcn1Q05186 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rcn1Q05186 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rcn1Q05186 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rcn1Q05186 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rcn1Q05186 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rcn1Q05186 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rcn1Q05186 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rcn1Q05186 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rcn1Q05186 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rcn1Q05186 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rcn1Q05186 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rcn1Q05186 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rcn1Q05186 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rcn1Q05186 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rcn1Q05186 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rcn1Q05186 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rcn1Q05186 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rcn1Q05186 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rcn1Q05186 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rcn1Q05186 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rcn1Q05186 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rcn1Q05186 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rcn1Q05186 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rcn1Q05186 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rcn1Q05186 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rcn1Q05186 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rcn1Q05186 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rcn1Q05186 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rcn1Q05186 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rcn1Q05186 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rcn1Q05186 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rcn1Q05186 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rcn1Q05186 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rcn1Q05186 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rcn1Q05186 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rcn1Q05186 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rcn1Q05186 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rcn1Q05186 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rcn1Q05186 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rcn1Q05186 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rcn1Q05186 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rcn1Q05186 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rcn1Q05186 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rcn1Q05186 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rcn1Q05186 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rcn1Q05186 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rcn1Q05186 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rcn1Q05186 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rcn1Q05186 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rcn1Q05186 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rcn1Q05186 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rcn1Q05186 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rcn1Q05186 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rcn1Q05186 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rcn1Q05186 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rcn1Q05186 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rcn1Q05186 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rcn1Q05186 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rcn1Q05186 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rcn1Q05186 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rcn1Q05186 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rcn1Q05186 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rcn1Q05186 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rcn1Q05186 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rcn1Q05186 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rcn1Q05186 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rcn1Q05186 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rcn1Q05186 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rcn1Q05186 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rcn1Q05186 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rcn1Q05186 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rcn1Q05186 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rcn1Q05186 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rcn1Q05186 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rcn1Q05186 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rcn1Q05186 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rcn1Q05186 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rcn1Q05186 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rcn1Q05186 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rcn1Q05186 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rcn1Q05186 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rcn1Q05186 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rcn1Q05186 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rcn1Q05186 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rcn1Q05186 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rcn1Q05186 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms