Protein–RNA interactions for Protein: Q04886

Sox8, Transcription factor SOX-8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox8Q04886 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sox8Q04886 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sox8Q04886 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sox8Q04886 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sox8Q04886 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sox8Q04886 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sox8Q04886 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sox8Q04886 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sox8Q04886 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Sox8Q04886 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sox8Q04886 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sox8Q04886 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sox8Q04886 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sox8Q04886 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sox8Q04886 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sox8Q04886 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sox8Q04886 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sox8Q04886 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sox8Q04886 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sox8Q04886 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sox8Q04886 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sox8Q04886 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sox8Q04886 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sox8Q04886 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sox8Q04886 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sox8Q04886 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sox8Q04886 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sox8Q04886 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sox8Q04886 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sox8Q04886 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sox8Q04886 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sox8Q04886 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sox8Q04886 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sox8Q04886 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sox8Q04886 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sox8Q04886 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sox8Q04886 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sox8Q04886 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sox8Q04886 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox8Q04886 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox8Q04886 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox8Q04886 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox8Q04886 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox8Q04886 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox8Q04886 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox8Q04886 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox8Q04886 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox8Q04886 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox8Q04886 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox8Q04886 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox8Q04886 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox8Q04886 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox8Q04886 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox8Q04886 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox8Q04886 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox8Q04886 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox8Q04886 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox8Q04886 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox8Q04886 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox8Q04886 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox8Q04886 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox8Q04886 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox8Q04886 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox8Q04886 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox8Q04886 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sox8Q04886 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sox8Q04886 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sox8Q04886 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sox8Q04886 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sox8Q04886 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sox8Q04886 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Sox8Q04886 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sox8Q04886 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sox8Q04886 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Sox8Q04886 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sox8Q04886 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sox8Q04886 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Sox8Q04886 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Sox8Q04886 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sox8Q04886 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sox8Q04886 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sox8Q04886 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sox8Q04886 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sox8Q04886 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sox8Q04886 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sox8Q04886 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sox8Q04886 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sox8Q04886 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sox8Q04886 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Sox8Q04886 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Sox8Q04886 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sox8Q04886 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sox8Q04886 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sox8Q04886 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sox8Q04886 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sox8Q04886 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sox8Q04886 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sox8Q04886 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sox8Q04886 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sox8Q04886 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms