Protein–RNA interactions for Protein: Q04692

Smarcad1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcad1Q04692 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smarcad1Q04692 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smarcad1Q04692 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smarcad1Q04692 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Smarcad1Q04692 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smarcad1Q04692 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smarcad1Q04692 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smarcad1Q04692 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smarcad1Q04692 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smarcad1Q04692 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smarcad1Q04692 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smarcad1Q04692 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smarcad1Q04692 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smarcad1Q04692 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smarcad1Q04692 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smarcad1Q04692 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smarcad1Q04692 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smarcad1Q04692 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smarcad1Q04692 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smarcad1Q04692 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smarcad1Q04692 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smarcad1Q04692 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smarcad1Q04692 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smarcad1Q04692 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smarcad1Q04692 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smarcad1Q04692 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smarcad1Q04692 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smarcad1Q04692 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smarcad1Q04692 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smarcad1Q04692 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smarcad1Q04692 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smarcad1Q04692 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smarcad1Q04692 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smarcad1Q04692 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smarcad1Q04692 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smarcad1Q04692 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smarcad1Q04692 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smarcad1Q04692 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smarcad1Q04692 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smarcad1Q04692 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Smarcad1Q04692 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smarcad1Q04692 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smarcad1Q04692 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smarcad1Q04692 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smarcad1Q04692 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smarcad1Q04692 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smarcad1Q04692 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smarcad1Q04692 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smarcad1Q04692 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smarcad1Q04692 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smarcad1Q04692 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smarcad1Q04692 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smarcad1Q04692 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smarcad1Q04692 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smarcad1Q04692 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smarcad1Q04692 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smarcad1Q04692 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smarcad1Q04692 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smarcad1Q04692 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smarcad1Q04692 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smarcad1Q04692 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smarcad1Q04692 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smarcad1Q04692 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smarcad1Q04692 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smarcad1Q04692 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smarcad1Q04692 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smarcad1Q04692 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smarcad1Q04692 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smarcad1Q04692 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smarcad1Q04692 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smarcad1Q04692 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smarcad1Q04692 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smarcad1Q04692 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smarcad1Q04692 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smarcad1Q04692 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smarcad1Q04692 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smarcad1Q04692 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smarcad1Q04692 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smarcad1Q04692 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smarcad1Q04692 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smarcad1Q04692 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Smarcad1Q04692 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smarcad1Q04692 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smarcad1Q04692 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smarcad1Q04692 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smarcad1Q04692 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smarcad1Q04692 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smarcad1Q04692 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smarcad1Q04692 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smarcad1Q04692 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smarcad1Q04692 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smarcad1Q04692 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smarcad1Q04692 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smarcad1Q04692 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smarcad1Q04692 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smarcad1Q04692 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smarcad1Q04692 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smarcad1Q04692 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smarcad1Q04692 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smarcad1Q04692 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms