Protein–RNA interactions for Protein: Q03401

Crisp1, Cysteine-rich secretory protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crisp1Q03401 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Crisp1Q03401 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Crisp1Q03401 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Crisp1Q03401 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Crisp1Q03401 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Crisp1Q03401 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Crisp1Q03401 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Crisp1Q03401 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Crisp1Q03401 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Crisp1Q03401 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Crisp1Q03401 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Crisp1Q03401 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Crisp1Q03401 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Crisp1Q03401 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Crisp1Q03401 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Crisp1Q03401 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Crisp1Q03401 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Crisp1Q03401 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Crisp1Q03401 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Crisp1Q03401 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Crisp1Q03401 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Crisp1Q03401 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Crisp1Q03401 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Crisp1Q03401 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Crisp1Q03401 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Crisp1Q03401 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Crisp1Q03401 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Crisp1Q03401 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Crisp1Q03401 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Crisp1Q03401 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Crisp1Q03401 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Crisp1Q03401 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Crisp1Q03401 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Crisp1Q03401 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Crisp1Q03401 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Crisp1Q03401 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Crisp1Q03401 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Crisp1Q03401 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Crisp1Q03401 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Crisp1Q03401 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Crisp1Q03401 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Crisp1Q03401 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Crisp1Q03401 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Crisp1Q03401 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Crisp1Q03401 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Crisp1Q03401 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Crisp1Q03401 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Crisp1Q03401 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Crisp1Q03401 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Crisp1Q03401 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Crisp1Q03401 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Crisp1Q03401 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Crisp1Q03401 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Crisp1Q03401 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Crisp1Q03401 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Crisp1Q03401 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Crisp1Q03401 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Crisp1Q03401 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Crisp1Q03401 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Crisp1Q03401 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Crisp1Q03401 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Crisp1Q03401 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Crisp1Q03401 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Crisp1Q03401 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Crisp1Q03401 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Crisp1Q03401 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Crisp1Q03401 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Crisp1Q03401 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Crisp1Q03401 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Crisp1Q03401 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Crisp1Q03401 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Crisp1Q03401 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Crisp1Q03401 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Crisp1Q03401 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Crisp1Q03401 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Crisp1Q03401 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Crisp1Q03401 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Crisp1Q03401 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Crisp1Q03401 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Crisp1Q03401 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Crisp1Q03401 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Crisp1Q03401 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Crisp1Q03401 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Crisp1Q03401 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Crisp1Q03401 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Crisp1Q03401 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Crisp1Q03401 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Crisp1Q03401 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Crisp1Q03401 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Crisp1Q03401 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Crisp1Q03401 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Crisp1Q03401 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Crisp1Q03401 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Crisp1Q03401 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Crisp1Q03401 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Crisp1Q03401 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Crisp1Q03401 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Crisp1Q03401 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Crisp1Q03401 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Crisp1Q03401 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms