Protein–RNA interactions for Protein: Q02738

Gjb4, Gap junction beta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb4Q02738 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gjb4Q02738 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gjb4Q02738 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gjb4Q02738 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gjb4Q02738 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gjb4Q02738 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gjb4Q02738 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gjb4Q02738 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gjb4Q02738 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gjb4Q02738 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gjb4Q02738 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gjb4Q02738 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gjb4Q02738 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gjb4Q02738 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gjb4Q02738 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gjb4Q02738 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gjb4Q02738 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gjb4Q02738 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gjb4Q02738 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gjb4Q02738 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gjb4Q02738 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gjb4Q02738 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gjb4Q02738 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gjb4Q02738 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gjb4Q02738 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gjb4Q02738 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gjb4Q02738 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gjb4Q02738 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gjb4Q02738 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gjb4Q02738 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gjb4Q02738 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gjb4Q02738 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gjb4Q02738 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gjb4Q02738 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gjb4Q02738 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gjb4Q02738 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Gjb4Q02738 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gjb4Q02738 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gjb4Q02738 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gjb4Q02738 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gjb4Q02738 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gjb4Q02738 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gjb4Q02738 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gjb4Q02738 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gjb4Q02738 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gjb4Q02738 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gjb4Q02738 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gjb4Q02738 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gjb4Q02738 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gjb4Q02738 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gjb4Q02738 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gjb4Q02738 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gjb4Q02738 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gjb4Q02738 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gjb4Q02738 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gjb4Q02738 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gjb4Q02738 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gjb4Q02738 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gjb4Q02738 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gjb4Q02738 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gjb4Q02738 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gjb4Q02738 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gjb4Q02738 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gjb4Q02738 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gjb4Q02738 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gjb4Q02738 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gjb4Q02738 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gjb4Q02738 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gjb4Q02738 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gjb4Q02738 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Gjb4Q02738 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gjb4Q02738 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gjb4Q02738 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gjb4Q02738 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gjb4Q02738 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gjb4Q02738 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gjb4Q02738 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gjb4Q02738 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gjb4Q02738 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gjb4Q02738 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gjb4Q02738 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gjb4Q02738 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gjb4Q02738 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Gjb4Q02738 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gjb4Q02738 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gjb4Q02738 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Gjb4Q02738 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Gjb4Q02738 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gjb4Q02738 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gjb4Q02738 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gjb4Q02738 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gjb4Q02738 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gjb4Q02738 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gjb4Q02738 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gjb4Q02738 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gjb4Q02738 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Gjb4Q02738 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gjb4Q02738 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gjb4Q02738 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gjb4Q02738 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms