Protein–RNA interactions for Protein: Q02576

Nhlh1, Helix-loop-helix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlh1Q02576 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Nhlh1Q02576 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Nhlh1Q02576 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nhlh1Q02576 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Nhlh1Q02576 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nhlh1Q02576 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Nhlh1Q02576 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Nhlh1Q02576 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nhlh1Q02576 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nhlh1Q02576 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nhlh1Q02576 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nhlh1Q02576 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nhlh1Q02576 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nhlh1Q02576 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nhlh1Q02576 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nhlh1Q02576 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nhlh1Q02576 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nhlh1Q02576 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Nhlh1Q02576 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nhlh1Q02576 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nhlh1Q02576 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nhlh1Q02576 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nhlh1Q02576 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nhlh1Q02576 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Nhlh1Q02576 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nhlh1Q02576 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Nhlh1Q02576 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nhlh1Q02576 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nhlh1Q02576 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nhlh1Q02576 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nhlh1Q02576 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nhlh1Q02576 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nhlh1Q02576 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nhlh1Q02576 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nhlh1Q02576 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nhlh1Q02576 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nhlh1Q02576 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nhlh1Q02576 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nhlh1Q02576 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nhlh1Q02576 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nhlh1Q02576 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nhlh1Q02576 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nhlh1Q02576 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nhlh1Q02576 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nhlh1Q02576 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nhlh1Q02576 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nhlh1Q02576 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nhlh1Q02576 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nhlh1Q02576 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nhlh1Q02576 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nhlh1Q02576 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nhlh1Q02576 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nhlh1Q02576 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Nhlh1Q02576 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Nhlh1Q02576 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nhlh1Q02576 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nhlh1Q02576 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nhlh1Q02576 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nhlh1Q02576 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nhlh1Q02576 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nhlh1Q02576 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nhlh1Q02576 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nhlh1Q02576 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nhlh1Q02576 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nhlh1Q02576 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nhlh1Q02576 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nhlh1Q02576 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nhlh1Q02576 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nhlh1Q02576 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Nhlh1Q02576 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nhlh1Q02576 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Nhlh1Q02576 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Nhlh1Q02576 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nhlh1Q02576 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nhlh1Q02576 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nhlh1Q02576 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nhlh1Q02576 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nhlh1Q02576 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nhlh1Q02576 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nhlh1Q02576 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nhlh1Q02576 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nhlh1Q02576 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nhlh1Q02576 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nhlh1Q02576 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nhlh1Q02576 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nhlh1Q02576 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nhlh1Q02576 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nhlh1Q02576 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nhlh1Q02576 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nhlh1Q02576 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Nhlh1Q02576 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Nhlh1Q02576 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Nhlh1Q02576 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nhlh1Q02576 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Nhlh1Q02576 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nhlh1Q02576 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nhlh1Q02576 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nhlh1Q02576 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nhlh1Q02576 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nhlh1Q02576 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms