Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna1cQ01815 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna1cQ01815 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna1cQ01815 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna1cQ01815 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna1cQ01815 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna1cQ01815 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna1cQ01815 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna1cQ01815 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna1cQ01815 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna1cQ01815 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacna1cQ01815 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacna1cQ01815 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacna1cQ01815 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacna1cQ01815 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacna1cQ01815 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacna1cQ01815 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacna1cQ01815 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacna1cQ01815 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacna1cQ01815 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacna1cQ01815 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacna1cQ01815 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacna1cQ01815 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacna1cQ01815 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacna1cQ01815 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacna1cQ01815 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacna1cQ01815 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacna1cQ01815 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacna1cQ01815 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacna1cQ01815 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacna1cQ01815 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacna1cQ01815 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacna1cQ01815 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacna1cQ01815 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacna1cQ01815 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacna1cQ01815 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacna1cQ01815 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna1cQ01815 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna1cQ01815 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna1cQ01815 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna1cQ01815 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna1cQ01815 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna1cQ01815 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna1cQ01815 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna1cQ01815 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna1cQ01815 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna1cQ01815 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna1cQ01815 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna1cQ01815 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna1cQ01815 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna1cQ01815 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna1cQ01815 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna1cQ01815 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna1cQ01815 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna1cQ01815 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna1cQ01815 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna1cQ01815 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna1cQ01815 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna1cQ01815 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna1cQ01815 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna1cQ01815 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna1cQ01815 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna1cQ01815 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna1cQ01815 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacna1cQ01815 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacna1cQ01815 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacna1cQ01815 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacna1cQ01815 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacna1cQ01815 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacna1cQ01815 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacna1cQ01815 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacna1cQ01815 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacna1cQ01815 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacna1cQ01815 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacna1cQ01815 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacna1cQ01815 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacna1cQ01815 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacna1cQ01815 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacna1cQ01815 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacna1cQ01815 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacna1cQ01815 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacna1cQ01815 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacna1cQ01815 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacna1cQ01815 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacna1cQ01815 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacna1cQ01815 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacna1cQ01815 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Cacna1cQ01815 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cacna1cQ01815 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cacna1cQ01815 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cacna1cQ01815 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cacna1cQ01815 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cacna1cQ01815 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cacna1cQ01815 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cacna1cQ01815 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cacna1cQ01815 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cacna1cQ01815 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cacna1cQ01815 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cacna1cQ01815 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cacna1cQ01815 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms