Protein–RNA interactions for Protein: Q01514

Gbp1, Guanylate-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp1Q01514 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gbp1Q01514 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gbp1Q01514 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gbp1Q01514 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gbp1Q01514 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Gbp1Q01514 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gbp1Q01514 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gbp1Q01514 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gbp1Q01514 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Gbp1Q01514 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Gbp1Q01514 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Gbp1Q01514 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Gbp1Q01514 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gbp1Q01514 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gbp1Q01514 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gbp1Q01514 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gbp1Q01514 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gbp1Q01514 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gbp1Q01514 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gbp1Q01514 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gbp1Q01514 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gbp1Q01514 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gbp1Q01514 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gbp1Q01514 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gbp1Q01514 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gbp1Q01514 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gbp1Q01514 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gbp1Q01514 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gbp1Q01514 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gbp1Q01514 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gbp1Q01514 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gbp1Q01514 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gbp1Q01514 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gbp1Q01514 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gbp1Q01514 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gbp1Q01514 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gbp1Q01514 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gbp1Q01514 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gbp1Q01514 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gbp1Q01514 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gbp1Q01514 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gbp1Q01514 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gbp1Q01514 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gbp1Q01514 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gbp1Q01514 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gbp1Q01514 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gbp1Q01514 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gbp1Q01514 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gbp1Q01514 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gbp1Q01514 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gbp1Q01514 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gbp1Q01514 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gbp1Q01514 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gbp1Q01514 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gbp1Q01514 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gbp1Q01514 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gbp1Q01514 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gbp1Q01514 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gbp1Q01514 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Gbp1Q01514 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gbp1Q01514 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gbp1Q01514 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Gbp1Q01514 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gbp1Q01514 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Gbp1Q01514 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gbp1Q01514 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gbp1Q01514 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gbp1Q01514 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gbp1Q01514 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gbp1Q01514 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gbp1Q01514 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gbp1Q01514 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Gbp1Q01514 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gbp1Q01514 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gbp1Q01514 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gbp1Q01514 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gbp1Q01514 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gbp1Q01514 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gbp1Q01514 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gbp1Q01514 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gbp1Q01514 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gbp1Q01514 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gbp1Q01514 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gbp1Q01514 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Gbp1Q01514 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Gbp1Q01514 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gbp1Q01514 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gbp1Q01514 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gbp1Q01514 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gbp1Q01514 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gbp1Q01514 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gbp1Q01514 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gbp1Q01514 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gbp1Q01514 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gbp1Q01514 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gbp1Q01514 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gbp1Q01514 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gbp1Q01514 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gbp1Q01514 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gbp1Q01514 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms