Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pde1bQ01065 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pde1bQ01065 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pde1bQ01065 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pde1bQ01065 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pde1bQ01065 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pde1bQ01065 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pde1bQ01065 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pde1bQ01065 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pde1bQ01065 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pde1bQ01065 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pde1bQ01065 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pde1bQ01065 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pde1bQ01065 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pde1bQ01065 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pde1bQ01065 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pde1bQ01065 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pde1bQ01065 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pde1bQ01065 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pde1bQ01065 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pde1bQ01065 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pde1bQ01065 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pde1bQ01065 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pde1bQ01065 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pde1bQ01065 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pde1bQ01065 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Pde1bQ01065 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pde1bQ01065 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Pde1bQ01065 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pde1bQ01065 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pde1bQ01065 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pde1bQ01065 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pde1bQ01065 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pde1bQ01065 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pde1bQ01065 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pde1bQ01065 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pde1bQ01065 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pde1bQ01065 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pde1bQ01065 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pde1bQ01065 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pde1bQ01065 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pde1bQ01065 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pde1bQ01065 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pde1bQ01065 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pde1bQ01065 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pde1bQ01065 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pde1bQ01065 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pde1bQ01065 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pde1bQ01065 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pde1bQ01065 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pde1bQ01065 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pde1bQ01065 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pde1bQ01065 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pde1bQ01065 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pde1bQ01065 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pde1bQ01065 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pde1bQ01065 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pde1bQ01065 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pde1bQ01065 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pde1bQ01065 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pde1bQ01065 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pde1bQ01065 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pde1bQ01065 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pde1bQ01065 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pde1bQ01065 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pde1bQ01065 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pde1bQ01065 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pde1bQ01065 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pde1bQ01065 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pde1bQ01065 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pde1bQ01065 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pde1bQ01065 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pde1bQ01065 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pde1bQ01065 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pde1bQ01065 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pde1bQ01065 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Pde1bQ01065 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pde1bQ01065 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Pde1bQ01065 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pde1bQ01065 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pde1bQ01065 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pde1bQ01065 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Pde1bQ01065 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pde1bQ01065 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pde1bQ01065 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pde1bQ01065 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pde1bQ01065 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pde1bQ01065 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pde1bQ01065 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pde1bQ01065 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pde1bQ01065 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Pde1bQ01065 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pde1bQ01065 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pde1bQ01065 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pde1bQ01065 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pde1bQ01065 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pde1bQ01065 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Pde1bQ01065 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pde1bQ01065 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Pde1bQ01065 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms