Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gjb2Q00977 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gjb2Q00977 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gjb2Q00977 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gjb2Q00977 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gjb2Q00977 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gjb2Q00977 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gjb2Q00977 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gjb2Q00977 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gjb2Q00977 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Gjb2Q00977 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gjb2Q00977 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gjb2Q00977 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gjb2Q00977 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Gjb2Q00977 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gjb2Q00977 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gjb2Q00977 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gjb2Q00977 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gjb2Q00977 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gjb2Q00977 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gjb2Q00977 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gjb2Q00977 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gjb2Q00977 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gjb2Q00977 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gjb2Q00977 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gjb2Q00977 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gjb2Q00977 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gjb2Q00977 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gjb2Q00977 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gjb2Q00977 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gjb2Q00977 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gjb2Q00977 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gjb2Q00977 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gjb2Q00977 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gjb2Q00977 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gjb2Q00977 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gjb2Q00977 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gjb2Q00977 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gjb2Q00977 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gjb2Q00977 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gjb2Q00977 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gjb2Q00977 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gjb2Q00977 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gjb2Q00977 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gjb2Q00977 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gjb2Q00977 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gjb2Q00977 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gjb2Q00977 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gjb2Q00977 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gjb2Q00977 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gjb2Q00977 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gjb2Q00977 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gjb2Q00977 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gjb2Q00977 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Gjb2Q00977 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gjb2Q00977 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gjb2Q00977 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gjb2Q00977 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gjb2Q00977 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gjb2Q00977 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gjb2Q00977 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gjb2Q00977 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gjb2Q00977 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gjb2Q00977 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gjb2Q00977 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Gjb2Q00977 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Gjb2Q00977 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gjb2Q00977 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gjb2Q00977 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gjb2Q00977 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gjb2Q00977 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gjb2Q00977 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gjb2Q00977 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Gjb2Q00977 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Gjb2Q00977 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gjb2Q00977 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gjb2Q00977 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gjb2Q00977 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gjb2Q00977 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gjb2Q00977 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gjb2Q00977 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Gjb2Q00977 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Gjb2Q00977 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Gjb2Q00977 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Gjb2Q00977 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Gjb2Q00977 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gjb2Q00977 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gjb2Q00977 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gjb2Q00977 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gjb2Q00977 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gjb2Q00977 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gjb2Q00977 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gjb2Q00977 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gjb2Q00977 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gjb2Q00977 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gjb2Q00977 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gjb2Q00977 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gjb2Q00977 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gjb2Q00977 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gjb2Q00977 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms