Protein–RNA interactions for Protein: Q00420

Gabpb1, GA-binding protein subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb1Q00420 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabpb1Q00420 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gabpb1Q00420 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gabpb1Q00420 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gabpb1Q00420 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gabpb1Q00420 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gabpb1Q00420 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gabpb1Q00420 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gabpb1Q00420 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gabpb1Q00420 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gabpb1Q00420 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gabpb1Q00420 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gabpb1Q00420 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gabpb1Q00420 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gabpb1Q00420 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gabpb1Q00420 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gabpb1Q00420 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gabpb1Q00420 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gabpb1Q00420 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gabpb1Q00420 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gabpb1Q00420 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gabpb1Q00420 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gabpb1Q00420 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gabpb1Q00420 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gabpb1Q00420 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabpb1Q00420 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabpb1Q00420 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabpb1Q00420 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabpb1Q00420 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabpb1Q00420 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabpb1Q00420 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabpb1Q00420 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabpb1Q00420 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabpb1Q00420 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabpb1Q00420 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabpb1Q00420 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabpb1Q00420 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabpb1Q00420 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabpb1Q00420 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabpb1Q00420 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabpb1Q00420 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabpb1Q00420 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabpb1Q00420 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabpb1Q00420 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabpb1Q00420 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gabpb1Q00420 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gabpb1Q00420 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gabpb1Q00420 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gabpb1Q00420 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gabpb1Q00420 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gabpb1Q00420 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gabpb1Q00420 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gabpb1Q00420 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gabpb1Q00420 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gabpb1Q00420 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gabpb1Q00420 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gabpb1Q00420 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gabpb1Q00420 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gabpb1Q00420 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gabpb1Q00420 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gabpb1Q00420 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gabpb1Q00420 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gabpb1Q00420 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gabpb1Q00420 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gabpb1Q00420 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gabpb1Q00420 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gabpb1Q00420 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gabpb1Q00420 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gabpb1Q00420 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gabpb1Q00420 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gabpb1Q00420 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gabpb1Q00420 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gabpb1Q00420 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gabpb1Q00420 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gabpb1Q00420 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gabpb1Q00420 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gabpb1Q00420 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gabpb1Q00420 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gabpb1Q00420 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gabpb1Q00420 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gabpb1Q00420 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gabpb1Q00420 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gabpb1Q00420 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gabpb1Q00420 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gabpb1Q00420 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gabpb1Q00420 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gabpb1Q00420 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gabpb1Q00420 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gabpb1Q00420 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gabpb1Q00420 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gabpb1Q00420 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gabpb1Q00420 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gabpb1Q00420 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gabpb1Q00420 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gabpb1Q00420 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gabpb1Q00420 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gabpb1Q00420 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gabpb1Q00420 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gabpb1Q00420 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gabpb1Q00420 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms