Protein–RNA interactions for Protein: Q000W5

Gbp10, Guanylate-binding protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp10Q000W5 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gbp10Q000W5 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gbp10Q000W5 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gbp10Q000W5 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gbp10Q000W5 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gbp10Q000W5 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gbp10Q000W5 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gbp10Q000W5 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gbp10Q000W5 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gbp10Q000W5 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gbp10Q000W5 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gbp10Q000W5 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gbp10Q000W5 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gbp10Q000W5 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gbp10Q000W5 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gbp10Q000W5 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gbp10Q000W5 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gbp10Q000W5 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gbp10Q000W5 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gbp10Q000W5 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gbp10Q000W5 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gbp10Q000W5 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gbp10Q000W5 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gbp10Q000W5 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gbp10Q000W5 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gbp10Q000W5 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gbp10Q000W5 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gbp10Q000W5 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gbp10Q000W5 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gbp10Q000W5 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gbp10Q000W5 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gbp10Q000W5 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gbp10Q000W5 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gbp10Q000W5 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gbp10Q000W5 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gbp10Q000W5 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gbp10Q000W5 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gbp10Q000W5 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gbp10Q000W5 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gbp10Q000W5 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gbp10Q000W5 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gbp10Q000W5 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gbp10Q000W5 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gbp10Q000W5 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gbp10Q000W5 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gbp10Q000W5 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gbp10Q000W5 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gbp10Q000W5 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gbp10Q000W5 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gbp10Q000W5 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gbp10Q000W5 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gbp10Q000W5 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gbp10Q000W5 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gbp10Q000W5 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gbp10Q000W5 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gbp10Q000W5 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gbp10Q000W5 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gbp10Q000W5 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gbp10Q000W5 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gbp10Q000W5 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gbp10Q000W5 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbp10Q000W5 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbp10Q000W5 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbp10Q000W5 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbp10Q000W5 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbp10Q000W5 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbp10Q000W5 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbp10Q000W5 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbp10Q000W5 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbp10Q000W5 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbp10Q000W5 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbp10Q000W5 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbp10Q000W5 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbp10Q000W5 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbp10Q000W5 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbp10Q000W5 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbp10Q000W5 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbp10Q000W5 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbp10Q000W5 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbp10Q000W5 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbp10Q000W5 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbp10Q000W5 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbp10Q000W5 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbp10Q000W5 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbp10Q000W5 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbp10Q000W5 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbp10Q000W5 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbp10Q000W5 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbp10Q000W5 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbp10Q000W5 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbp10Q000W5 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbp10Q000W5 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbp10Q000W5 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbp10Q000W5 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbp10Q000W5 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbp10Q000W5 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbp10Q000W5 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbp10Q000W5 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbp10Q000W5 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbp10Q000W5 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms