Protein–RNA interactions for Protein: P98083

Shc1, SHC-transforming protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shc1P98083 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Shc1P98083 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Shc1P98083 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shc1P98083 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shc1P98083 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shc1P98083 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shc1P98083 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shc1P98083 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shc1P98083 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shc1P98083 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shc1P98083 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shc1P98083 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shc1P98083 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shc1P98083 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shc1P98083 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shc1P98083 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shc1P98083 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shc1P98083 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shc1P98083 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shc1P98083 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shc1P98083 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shc1P98083 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shc1P98083 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shc1P98083 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shc1P98083 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shc1P98083 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shc1P98083 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shc1P98083 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shc1P98083 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shc1P98083 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shc1P98083 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shc1P98083 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shc1P98083 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shc1P98083 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shc1P98083 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shc1P98083 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shc1P98083 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shc1P98083 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shc1P98083 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Shc1P98083 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shc1P98083 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Shc1P98083 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shc1P98083 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shc1P98083 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shc1P98083 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Shc1P98083 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shc1P98083 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shc1P98083 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shc1P98083 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shc1P98083 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shc1P98083 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shc1P98083 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shc1P98083 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shc1P98083 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shc1P98083 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shc1P98083 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shc1P98083 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shc1P98083 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shc1P98083 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shc1P98083 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shc1P98083 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Shc1P98083 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shc1P98083 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shc1P98083 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shc1P98083 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shc1P98083 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shc1P98083 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shc1P98083 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shc1P98083 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shc1P98083 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shc1P98083 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shc1P98083 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shc1P98083 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shc1P98083 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shc1P98083 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shc1P98083 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shc1P98083 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shc1P98083 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shc1P98083 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shc1P98083 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Shc1P98083 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shc1P98083 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shc1P98083 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shc1P98083 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shc1P98083 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shc1P98083 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shc1P98083 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shc1P98083 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shc1P98083 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shc1P98083 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shc1P98083 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shc1P98083 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shc1P98083 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shc1P98083 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shc1P98083 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shc1P98083 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shc1P98083 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shc1P98083 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shc1P98083 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shc1P98083 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms