Protein–RNA interactions for Protein: P97489

Gata5, Transcription factor GATA-5, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata5P97489 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gata5P97489 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gata5P97489 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gata5P97489 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gata5P97489 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gata5P97489 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gata5P97489 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gata5P97489 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gata5P97489 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gata5P97489 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gata5P97489 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gata5P97489 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gata5P97489 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gata5P97489 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gata5P97489 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gata5P97489 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gata5P97489 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gata5P97489 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gata5P97489 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gata5P97489 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gata5P97489 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gata5P97489 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gata5P97489 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gata5P97489 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gata5P97489 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gata5P97489 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gata5P97489 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gata5P97489 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gata5P97489 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gata5P97489 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gata5P97489 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gata5P97489 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gata5P97489 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gata5P97489 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gata5P97489 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gata5P97489 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gata5P97489 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gata5P97489 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gata5P97489 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gata5P97489 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gata5P97489 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gata5P97489 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gata5P97489 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gata5P97489 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gata5P97489 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gata5P97489 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gata5P97489 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gata5P97489 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gata5P97489 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gata5P97489 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gata5P97489 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gata5P97489 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gata5P97489 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gata5P97489 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gata5P97489 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gata5P97489 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gata5P97489 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gata5P97489 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gata5P97489 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gata5P97489 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gata5P97489 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gata5P97489 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gata5P97489 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gata5P97489 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gata5P97489 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gata5P97489 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gata5P97489 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gata5P97489 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gata5P97489 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gata5P97489 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gata5P97489 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gata5P97489 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gata5P97489 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gata5P97489 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gata5P97489 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gata5P97489 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gata5P97489 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gata5P97489 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gata5P97489 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gata5P97489 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gata5P97489 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gata5P97489 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gata5P97489 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gata5P97489 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gata5P97489 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gata5P97489 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gata5P97489 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gata5P97489 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gata5P97489 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gata5P97489 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gata5P97489 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gata5P97489 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gata5P97489 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gata5P97489 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gata5P97489 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gata5P97489 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gata5P97489 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gata5P97489 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gata5P97489 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gata5P97489 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms