Protein–RNA interactions for Protein: P97443

Smyd1, Histone-lysine N-methyltransferase Smyd1, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smyd1P97443 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smyd1P97443 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smyd1P97443 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smyd1P97443 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smyd1P97443 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smyd1P97443 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smyd1P97443 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smyd1P97443 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smyd1P97443 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smyd1P97443 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smyd1P97443 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Smyd1P97443 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smyd1P97443 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smyd1P97443 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smyd1P97443 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smyd1P97443 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smyd1P97443 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smyd1P97443 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smyd1P97443 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smyd1P97443 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smyd1P97443 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smyd1P97443 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smyd1P97443 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smyd1P97443 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smyd1P97443 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smyd1P97443 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smyd1P97443 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smyd1P97443 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smyd1P97443 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smyd1P97443 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smyd1P97443 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Smyd1P97443 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smyd1P97443 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Smyd1P97443 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Smyd1P97443 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smyd1P97443 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Smyd1P97443 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smyd1P97443 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Smyd1P97443 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smyd1P97443 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smyd1P97443 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smyd1P97443 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smyd1P97443 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smyd1P97443 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Smyd1P97443 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smyd1P97443 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smyd1P97443 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smyd1P97443 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smyd1P97443 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smyd1P97443 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smyd1P97443 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smyd1P97443 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smyd1P97443 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smyd1P97443 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smyd1P97443 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smyd1P97443 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smyd1P97443 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smyd1P97443 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smyd1P97443 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smyd1P97443 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smyd1P97443 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Smyd1P97443 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smyd1P97443 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smyd1P97443 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smyd1P97443 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smyd1P97443 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smyd1P97443 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smyd1P97443 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smyd1P97443 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smyd1P97443 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smyd1P97443 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smyd1P97443 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smyd1P97443 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smyd1P97443 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smyd1P97443 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smyd1P97443 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smyd1P97443 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smyd1P97443 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smyd1P97443 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smyd1P97443 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smyd1P97443 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smyd1P97443 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Smyd1P97443 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Smyd1P97443 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smyd1P97443 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smyd1P97443 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smyd1P97443 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smyd1P97443 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smyd1P97443 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smyd1P97443 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smyd1P97443 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smyd1P97443 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smyd1P97443 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smyd1P97443 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smyd1P97443 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smyd1P97443 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smyd1P97443 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smyd1P97443 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smyd1P97443 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smyd1P97443 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms