Protein–RNA interactions for Protein: P86793

Ccl21c, C-C motif chemokine 21c, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl21cP86793 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccl21cP86793 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
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Ccl21cP86793 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccl21cP86793 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccl21cP86793 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Ccl21cP86793 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccl21cP86793 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Ccl21cP86793 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Ccl21cP86793 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Ccl21cP86793 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccl21cP86793 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Ccl21cP86793 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Ccl21cP86793 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccl21cP86793 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccl21cP86793 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccl21cP86793 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccl21cP86793 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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Ccl21cP86793 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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Ccl21cP86793 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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Ccl21cP86793 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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Ccl21cP86793 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccl21cP86793 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccl21cP86793 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccl21cP86793 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccl21cP86793 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccl21cP86793 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccl21cP86793 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccl21cP86793 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccl21cP86793 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccl21cP86793 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
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Ccl21cP86793 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccl21cP86793 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
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Ccl21cP86793 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccl21cP86793 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccl21cP86793 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccl21cP86793 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccl21cP86793 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccl21cP86793 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccl21cP86793 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccl21cP86793 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccl21cP86793 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccl21cP86793 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccl21cP86793 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccl21cP86793 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccl21cP86793 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccl21cP86793 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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