Protein–RNA interactions for Protein: P85442

Vgll3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll3P85442 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vgll3P85442 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vgll3P85442 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vgll3P85442 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vgll3P85442 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vgll3P85442 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vgll3P85442 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vgll3P85442 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vgll3P85442 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vgll3P85442 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vgll3P85442 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vgll3P85442 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vgll3P85442 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vgll3P85442 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vgll3P85442 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vgll3P85442 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vgll3P85442 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vgll3P85442 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vgll3P85442 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vgll3P85442 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vgll3P85442 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vgll3P85442 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vgll3P85442 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vgll3P85442 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vgll3P85442 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vgll3P85442 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vgll3P85442 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vgll3P85442 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vgll3P85442 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vgll3P85442 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vgll3P85442 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vgll3P85442 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Vgll3P85442 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vgll3P85442 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vgll3P85442 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vgll3P85442 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vgll3P85442 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vgll3P85442 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vgll3P85442 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vgll3P85442 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vgll3P85442 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vgll3P85442 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vgll3P85442 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Vgll3P85442 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vgll3P85442 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vgll3P85442 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vgll3P85442 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vgll3P85442 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vgll3P85442 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vgll3P85442 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vgll3P85442 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vgll3P85442 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vgll3P85442 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vgll3P85442 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vgll3P85442 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vgll3P85442 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vgll3P85442 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vgll3P85442 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vgll3P85442 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vgll3P85442 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vgll3P85442 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vgll3P85442 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vgll3P85442 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vgll3P85442 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Vgll3P85442 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vgll3P85442 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vgll3P85442 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Vgll3P85442 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vgll3P85442 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vgll3P85442 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vgll3P85442 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vgll3P85442 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vgll3P85442 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vgll3P85442 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vgll3P85442 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Vgll3P85442 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vgll3P85442 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vgll3P85442 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vgll3P85442 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vgll3P85442 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vgll3P85442 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vgll3P85442 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vgll3P85442 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vgll3P85442 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vgll3P85442 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vgll3P85442 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vgll3P85442 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vgll3P85442 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vgll3P85442 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vgll3P85442 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vgll3P85442 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vgll3P85442 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vgll3P85442 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vgll3P85442 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vgll3P85442 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vgll3P85442 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vgll3P85442 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Vgll3P85442 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vgll3P85442 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vgll3P85442 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms