Protein–RNA interactions for Protein: P82976

Gbx1, Homeobox protein GBX-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx1P82976 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbx1P82976 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbx1P82976 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbx1P82976 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbx1P82976 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbx1P82976 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbx1P82976 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbx1P82976 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbx1P82976 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbx1P82976 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbx1P82976 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbx1P82976 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbx1P82976 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbx1P82976 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbx1P82976 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbx1P82976 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbx1P82976 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbx1P82976 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gbx1P82976 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gbx1P82976 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gbx1P82976 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gbx1P82976 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gbx1P82976 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gbx1P82976 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gbx1P82976 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gbx1P82976 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gbx1P82976 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gbx1P82976 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gbx1P82976 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gbx1P82976 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gbx1P82976 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gbx1P82976 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gbx1P82976 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gbx1P82976 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gbx1P82976 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gbx1P82976 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gbx1P82976 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gbx1P82976 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gbx1P82976 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gbx1P82976 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gbx1P82976 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gbx1P82976 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gbx1P82976 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gbx1P82976 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gbx1P82976 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gbx1P82976 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gbx1P82976 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gbx1P82976 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gbx1P82976 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gbx1P82976 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gbx1P82976 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gbx1P82976 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gbx1P82976 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gbx1P82976 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gbx1P82976 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gbx1P82976 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gbx1P82976 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gbx1P82976 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gbx1P82976 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gbx1P82976 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gbx1P82976 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gbx1P82976 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gbx1P82976 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gbx1P82976 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbx1P82976 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbx1P82976 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbx1P82976 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbx1P82976 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbx1P82976 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbx1P82976 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbx1P82976 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbx1P82976 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbx1P82976 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbx1P82976 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbx1P82976 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbx1P82976 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbx1P82976 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbx1P82976 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbx1P82976 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbx1P82976 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbx1P82976 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbx1P82976 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbx1P82976 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbx1P82976 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbx1P82976 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbx1P82976 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbx1P82976 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbx1P82976 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbx1P82976 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbx1P82976 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbx1P82976 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbx1P82976 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbx1P82976 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbx1P82976 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbx1P82976 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbx1P82976 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbx1P82976 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbx1P82976 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbx1P82976 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbx1P82976 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms