Protein–RNA interactions for Protein: P81069

Gabpb2, GA-binding protein subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb2P81069 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gabpb2P81069 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gabpb2P81069 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gabpb2P81069 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Gabpb2P81069 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gabpb2P81069 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gabpb2P81069 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gabpb2P81069 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gabpb2P81069 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gabpb2P81069 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gabpb2P81069 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gabpb2P81069 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gabpb2P81069 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Gabpb2P81069 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gabpb2P81069 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gabpb2P81069 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gabpb2P81069 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gabpb2P81069 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Gabpb2P81069 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gabpb2P81069 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gabpb2P81069 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gabpb2P81069 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gabpb2P81069 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gabpb2P81069 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gabpb2P81069 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gabpb2P81069 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gabpb2P81069 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gabpb2P81069 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gabpb2P81069 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gabpb2P81069 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Gabpb2P81069 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gabpb2P81069 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Gabpb2P81069 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gabpb2P81069 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gabpb2P81069 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gabpb2P81069 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gabpb2P81069 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gabpb2P81069 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gabpb2P81069 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gabpb2P81069 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gabpb2P81069 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gabpb2P81069 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gabpb2P81069 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gabpb2P81069 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gabpb2P81069 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gabpb2P81069 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Gabpb2P81069 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gabpb2P81069 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gabpb2P81069 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gabpb2P81069 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gabpb2P81069 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gabpb2P81069 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gabpb2P81069 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gabpb2P81069 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gabpb2P81069 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gabpb2P81069 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gabpb2P81069 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gabpb2P81069 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gabpb2P81069 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gabpb2P81069 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gabpb2P81069 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gabpb2P81069 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gabpb2P81069 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gabpb2P81069 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gabpb2P81069 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gabpb2P81069 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gabpb2P81069 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gabpb2P81069 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Gabpb2P81069 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gabpb2P81069 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Gabpb2P81069 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gabpb2P81069 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gabpb2P81069 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gabpb2P81069 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gabpb2P81069 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gabpb2P81069 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gabpb2P81069 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gabpb2P81069 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gabpb2P81069 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gabpb2P81069 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gabpb2P81069 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gabpb2P81069 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gabpb2P81069 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gabpb2P81069 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gabpb2P81069 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gabpb2P81069 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gabpb2P81069 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gabpb2P81069 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gabpb2P81069 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gabpb2P81069 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gabpb2P81069 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gabpb2P81069 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gabpb2P81069 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gabpb2P81069 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gabpb2P81069 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gabpb2P81069 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gabpb2P81069 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gabpb2P81069 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gabpb2P81069 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gabpb2P81069 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms