Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Irx3P81067 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Irx3P81067 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Irx3P81067 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Irx3P81067 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Irx3P81067 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Irx3P81067 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Irx3P81067 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Irx3P81067 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Irx3P81067 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Irx3P81067 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Irx3P81067 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Irx3P81067 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Irx3P81067 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Irx3P81067 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Irx3P81067 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Irx3P81067 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Irx3P81067 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Irx3P81067 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Irx3P81067 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Irx3P81067 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Irx3P81067 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Irx3P81067 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Irx3P81067 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Irx3P81067 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Irx3P81067 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Irx3P81067 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Irx3P81067 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Irx3P81067 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Irx3P81067 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Irx3P81067 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Irx3P81067 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Irx3P81067 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Irx3P81067 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Irx3P81067 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Irx3P81067 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Irx3P81067 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Irx3P81067 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Irx3P81067 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Irx3P81067 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Irx3P81067 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Irx3P81067 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Irx3P81067 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Irx3P81067 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Irx3P81067 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Irx3P81067 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Irx3P81067 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Irx3P81067 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Irx3P81067 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Irx3P81067 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Irx3P81067 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Irx3P81067 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Irx3P81067 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Irx3P81067 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Irx3P81067 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Irx3P81067 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Irx3P81067 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Irx3P81067 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Irx3P81067 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Irx3P81067 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Irx3P81067 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Irx3P81067 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Irx3P81067 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Irx3P81067 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Irx3P81067 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Irx3P81067 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Irx3P81067 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Irx3P81067 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Irx3P81067 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Irx3P81067 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Irx3P81067 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Irx3P81067 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Irx3P81067 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Irx3P81067 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Irx3P81067 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Irx3P81067 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Irx3P81067 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Irx3P81067 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Irx3P81067 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Irx3P81067 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Irx3P81067 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Irx3P81067 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Irx3P81067 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Irx3P81067 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Irx3P81067 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Irx3P81067 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Irx3P81067 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Irx3P81067 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Irx3P81067 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Irx3P81067 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Irx3P81067 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Irx3P81067 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Irx3P81067 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Irx3P81067 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Irx3P81067 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Irx3P81067 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Irx3P81067 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Irx3P81067 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Irx3P81067 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Irx3P81067 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms