Protein–RNA interactions for Protein: P70338

Gfi1, Zinc finger protein Gfi-1, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1P70338 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gfi1P70338 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gfi1P70338 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gfi1P70338 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gfi1P70338 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gfi1P70338 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gfi1P70338 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gfi1P70338 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gfi1P70338 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gfi1P70338 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gfi1P70338 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gfi1P70338 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gfi1P70338 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gfi1P70338 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gfi1P70338 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gfi1P70338 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gfi1P70338 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gfi1P70338 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gfi1P70338 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gfi1P70338 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gfi1P70338 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gfi1P70338 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gfi1P70338 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gfi1P70338 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gfi1P70338 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gfi1P70338 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gfi1P70338 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gfi1P70338 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gfi1P70338 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gfi1P70338 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gfi1P70338 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gfi1P70338 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gfi1P70338 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gfi1P70338 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gfi1P70338 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gfi1P70338 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gfi1P70338 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gfi1P70338 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gfi1P70338 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gfi1P70338 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gfi1P70338 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gfi1P70338 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gfi1P70338 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gfi1P70338 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gfi1P70338 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gfi1P70338 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gfi1P70338 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gfi1P70338 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gfi1P70338 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gfi1P70338 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gfi1P70338 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gfi1P70338 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gfi1P70338 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gfi1P70338 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gfi1P70338 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gfi1P70338 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gfi1P70338 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gfi1P70338 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gfi1P70338 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gfi1P70338 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gfi1P70338 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gfi1P70338 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gfi1P70338 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gfi1P70338 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gfi1P70338 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gfi1P70338 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gfi1P70338 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gfi1P70338 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gfi1P70338 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gfi1P70338 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gfi1P70338 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gfi1P70338 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gfi1P70338 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gfi1P70338 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gfi1P70338 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gfi1P70338 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gfi1P70338 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gfi1P70338 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gfi1P70338 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gfi1P70338 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gfi1P70338 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gfi1P70338 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gfi1P70338 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gfi1P70338 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gfi1P70338 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gfi1P70338 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gfi1P70338 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gfi1P70338 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gfi1P70338 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gfi1P70338 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gfi1P70338 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gfi1P70338 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gfi1P70338 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gfi1P70338 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gfi1P70338 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gfi1P70338 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gfi1P70338 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gfi1P70338 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gfi1P70338 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gfi1P70338 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms