Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Rps29P62274 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Rps29P62274 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Rps29P62274 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Rps29P62274 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC9.15□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC9.15□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Rps29P62274 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rps29P62274 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rps29P62274 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rps29P62274 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC9.13□□□□□ -0.95
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