Protein–RNA interactions for Protein: P61264

Stx1b, Syntaxin-1B, mousemouse

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx1bP61264 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stx1bP61264 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stx1bP61264 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stx1bP61264 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stx1bP61264 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stx1bP61264 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stx1bP61264 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stx1bP61264 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stx1bP61264 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stx1bP61264 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stx1bP61264 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stx1bP61264 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stx1bP61264 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stx1bP61264 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stx1bP61264 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stx1bP61264 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stx1bP61264 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stx1bP61264 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stx1bP61264 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Stx1bP61264 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stx1bP61264 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stx1bP61264 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stx1bP61264 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stx1bP61264 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stx1bP61264 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stx1bP61264 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stx1bP61264 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stx1bP61264 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stx1bP61264 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stx1bP61264 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stx1bP61264 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stx1bP61264 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stx1bP61264 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stx1bP61264 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stx1bP61264 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stx1bP61264 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stx1bP61264 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Stx1bP61264 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stx1bP61264 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stx1bP61264 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Stx1bP61264 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stx1bP61264 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stx1bP61264 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stx1bP61264 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stx1bP61264 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Stx1bP61264 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Stx1bP61264 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Stx1bP61264 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Stx1bP61264 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stx1bP61264 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stx1bP61264 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stx1bP61264 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stx1bP61264 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stx1bP61264 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stx1bP61264 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stx1bP61264 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stx1bP61264 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stx1bP61264 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stx1bP61264 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stx1bP61264 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Stx1bP61264 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stx1bP61264 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Stx1bP61264 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stx1bP61264 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stx1bP61264 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stx1bP61264 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stx1bP61264 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stx1bP61264 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stx1bP61264 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stx1bP61264 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stx1bP61264 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stx1bP61264 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stx1bP61264 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stx1bP61264 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stx1bP61264 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stx1bP61264 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Stx1bP61264 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stx1bP61264 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stx1bP61264 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stx1bP61264 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stx1bP61264 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stx1bP61264 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stx1bP61264 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stx1bP61264 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Stx1bP61264 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stx1bP61264 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stx1bP61264 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stx1bP61264 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stx1bP61264 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stx1bP61264 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stx1bP61264 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stx1bP61264 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stx1bP61264 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stx1bP61264 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stx1bP61264 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stx1bP61264 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stx1bP61264 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stx1bP61264 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stx1bP61264 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stx1bP61264 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms