Protein–RNA interactions for Protein: P61087

Ube2k, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 K, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2kP61087 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ube2kP61087 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ube2kP61087 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ube2kP61087 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ube2kP61087 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ube2kP61087 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ube2kP61087 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ube2kP61087 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ube2kP61087 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ube2kP61087 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ube2kP61087 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ube2kP61087 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ube2kP61087 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ube2kP61087 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ube2kP61087 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ube2kP61087 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ube2kP61087 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ube2kP61087 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ube2kP61087 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ube2kP61087 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ube2kP61087 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ube2kP61087 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ube2kP61087 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ube2kP61087 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ube2kP61087 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ube2kP61087 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ube2kP61087 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ube2kP61087 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ube2kP61087 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ube2kP61087 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ube2kP61087 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ube2kP61087 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ube2kP61087 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ube2kP61087 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ube2kP61087 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ube2kP61087 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ube2kP61087 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ube2kP61087 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ube2kP61087 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ube2kP61087 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ube2kP61087 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ube2kP61087 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ube2kP61087 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ube2kP61087 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ube2kP61087 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ube2kP61087 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ube2kP61087 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ube2kP61087 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ube2kP61087 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ube2kP61087 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ube2kP61087 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ube2kP61087 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ube2kP61087 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ube2kP61087 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ube2kP61087 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ube2kP61087 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ube2kP61087 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ube2kP61087 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ube2kP61087 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ube2kP61087 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ube2kP61087 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ube2kP61087 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ube2kP61087 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ube2kP61087 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ube2kP61087 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ube2kP61087 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ube2kP61087 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ube2kP61087 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ube2kP61087 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ube2kP61087 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ube2kP61087 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ube2kP61087 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ube2kP61087 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ube2kP61087 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ube2kP61087 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ube2kP61087 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube2kP61087 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms