Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ppfia3P60469 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ppfia3P60469 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ppfia3P60469 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ppfia3P60469 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ppfia3P60469 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ppfia3P60469 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ppfia3P60469 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ppfia3P60469 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ppfia3P60469 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ppfia3P60469 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ppfia3P60469 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ppfia3P60469 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ppfia3P60469 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ppfia3P60469 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ppfia3P60469 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ppfia3P60469 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ppfia3P60469 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ppfia3P60469 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ppfia3P60469 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ppfia3P60469 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ppfia3P60469 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ppfia3P60469 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ppfia3P60469 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ppfia3P60469 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ppfia3P60469 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ppfia3P60469 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ppfia3P60469 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ppfia3P60469 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ppfia3P60469 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ppfia3P60469 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ppfia3P60469 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ppfia3P60469 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ppfia3P60469 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ppfia3P60469 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ppfia3P60469 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ppfia3P60469 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ppfia3P60469 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ppfia3P60469 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ppfia3P60469 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ppfia3P60469 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Ppfia3P60469 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ppfia3P60469 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ppfia3P60469 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ppfia3P60469 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ppfia3P60469 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ppfia3P60469 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ppfia3P60469 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ppfia3P60469 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ppfia3P60469 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ppfia3P60469 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ppfia3P60469 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ppfia3P60469 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ppfia3P60469 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ppfia3P60469 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ppfia3P60469 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ppfia3P60469 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ppfia3P60469 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ppfia3P60469 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ppfia3P60469 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ppfia3P60469 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ppfia3P60469 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ppfia3P60469 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ppfia3P60469 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Ppfia3P60469 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ppfia3P60469 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ppfia3P60469 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ppfia3P60469 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ppfia3P60469 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ppfia3P60469 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ppfia3P60469 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ppfia3P60469 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ppfia3P60469 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ppfia3P60469 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ppfia3P60469 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ppfia3P60469 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ppfia3P60469 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ppfia3P60469 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ppfia3P60469 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ppfia3P60469 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ppfia3P60469 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ppfia3P60469 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ppfia3P60469 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Ppfia3P60469 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ppfia3P60469 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ppfia3P60469 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ppfia3P60469 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ppfia3P60469 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ppfia3P60469 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ppfia3P60469 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ppfia3P60469 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ppfia3P60469 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ppfia3P60469 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ppfia3P60469 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ppfia3P60469 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ppfia3P60469 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ppfia3P60469 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ppfia3P60469 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ppfia3P60469 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ppfia3P60469 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms