Protein–RNA interactions for Protein: P58774

Tpm2, Tropomyosin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm2P58774 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tpm2P58774 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tpm2P58774 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tpm2P58774 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tpm2P58774 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tpm2P58774 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tpm2P58774 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tpm2P58774 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tpm2P58774 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tpm2P58774 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tpm2P58774 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tpm2P58774 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tpm2P58774 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Tpm2P58774 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tpm2P58774 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tpm2P58774 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tpm2P58774 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tpm2P58774 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tpm2P58774 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tpm2P58774 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tpm2P58774 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tpm2P58774 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tpm2P58774 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tpm2P58774 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tpm2P58774 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tpm2P58774 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tpm2P58774 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tpm2P58774 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tpm2P58774 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tpm2P58774 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tpm2P58774 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tpm2P58774 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tpm2P58774 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tpm2P58774 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tpm2P58774 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tpm2P58774 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Tpm2P58774 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tpm2P58774 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tpm2P58774 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tpm2P58774 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tpm2P58774 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tpm2P58774 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tpm2P58774 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tpm2P58774 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tpm2P58774 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tpm2P58774 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tpm2P58774 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tpm2P58774 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tpm2P58774 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tpm2P58774 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Tpm2P58774 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tpm2P58774 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tpm2P58774 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tpm2P58774 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tpm2P58774 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tpm2P58774 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tpm2P58774 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tpm2P58774 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tpm2P58774 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Tpm2P58774 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tpm2P58774 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tpm2P58774 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tpm2P58774 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tpm2P58774 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tpm2P58774 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tpm2P58774 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tpm2P58774 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tpm2P58774 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tpm2P58774 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Tpm2P58774 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tpm2P58774 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tpm2P58774 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tpm2P58774 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tpm2P58774 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tpm2P58774 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tpm2P58774 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tpm2P58774 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tpm2P58774 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tpm2P58774 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tpm2P58774 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tpm2P58774 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tpm2P58774 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tpm2P58774 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tpm2P58774 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tpm2P58774 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tpm2P58774 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tpm2P58774 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tpm2P58774 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tpm2P58774 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tpm2P58774 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tpm2P58774 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tpm2P58774 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tpm2P58774 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tpm2P58774 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tpm2P58774 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tpm2P58774 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tpm2P58774 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tpm2P58774 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tpm2P58774 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tpm2P58774 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms