Protein–RNA interactions for Protein: P58686

UPF0184 protein C9orf16 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P58686 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
P58686 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
P58686 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
P58686 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
P58686 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
P58686 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
P58686 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
P58686 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
P58686 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
P58686 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
P58686 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
P58686 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
P58686 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
P58686 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
P58686 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
P58686 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
P58686 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
P58686 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
P58686 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
P58686 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
P58686 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
P58686 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
P58686 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
P58686 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
P58686 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
P58686 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
P58686 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
P58686 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
P58686 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
P58686 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
P58686 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
P58686 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
P58686 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
P58686 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
P58686 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
P58686 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
P58686 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
P58686 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
P58686 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
P58686 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
P58686 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
P58686 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
P58686 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
P58686 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
P58686 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
P58686 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
P58686 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
P58686 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
P58686 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
P58686 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
P58686 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
P58686 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
P58686 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
P58686 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
P58686 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
P58686 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
P58686 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
P58686 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
P58686 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
P58686 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
P58686 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
P58686 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
P58686 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
P58686 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
P58686 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
P58686 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
P58686 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
P58686 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
P58686 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
P58686 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
P58686 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
P58686 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
P58686 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
P58686 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
P58686 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
P58686 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
P58686 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
P58686 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
P58686 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
P58686 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
P58686 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
P58686 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
P58686 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
P58686 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
P58686 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
P58686 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
P58686 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
P58686 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
P58686 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
P58686 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
P58686 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
P58686 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
P58686 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
P58686 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
P58686 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
P58686 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
P58686 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
P58686 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
P58686 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
P58686 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms